Treceți la conținut
Folosiți fondurile HSA sau FSA
Secvențiați-vă genomul (se deschide într-un filă nouă)

Genă

PSORS1C1

psoriasis susceptibility 1 candidate 1

Rezumat

Localizare citogenetică
6p21.33
Coordonate
Cromozomul 6: 31.114.800–31.140.092 (GRCh38)
Exoni
6 de exoni pe 25,3 kb
Proteină
152 de aminoacizi
Denumiri alternative
SEEK1
Simboluri anterioare
C6orf16
Transcriptul MANE Select
ENST00000259881.10NM_014068.3
Tip de locus
Care codifică proteine
  • Foarte ridicată
  • Ridicată
  • Scăzută
  • Foarte scăzută

Rapoarte curatoriate relevante pentru această genă

Niciun raport Genome Test nu citește încă PSORS1C1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.

Structura genei PSORS1C1

  • Secvență codificatoare
  • Regiune netranslată
  • Intron
  • Sensul transcripției
  • Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Cromozomul 6, cu o paranteză în locul unde se află PSORS1C1. PSORS1C1 și încă 41 de gene în apropiere, pe cromozomul 6, între 30.627.446 și 31.627.445.Cromozomul 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2730,8 Mb31 Mb31,2 Mb31,4 Mb31,6 MbATAT1: 30.626.837–30.646.835, catena directăATAT1C6orf136: 30.647.003–30.653.225, catena directăDHX16: 30.652.469–30.673.059, catena inversăDHX16PPP1R18: 30.676.389–30.687.895, catena inversăNRM: 30.688.047–30.691.420, catena inversăNRMMDC1: 30.699.807–30.717.562, catena inversăMDC1TUBB: 30.717.435–30.725.538, catena directăTUBBFLOT1: 30.727.709–30.743.075, catena inversăFLOT1IER3: 30.743.199–30.744.555, catena inversăIER3DDR1: 30.876.421–30.900.978, catena directăDDR1GTF2H4: 30.907.517–30.914.119, catena directăVARS2: 30.914.205–30.928.614, catena directăVARS2SFTA2: 30.931.353–30.955.636, catena inversăSFTA2SFTA2-AS1: 30.934.523–30.938.824, catena directăSFTA2-AS1MUCL3: 30.940.973–30.954.221, catena directăMUCL3MUC21: 30.983.718–30.989.903, catena directăMUC21MUC22: 31.010.474–31.036.882, catena directăMUC22C6orf15: 31.111.223–31.112.582, catena inversăC6orf15PSORS1C1: 31.114.800–31.140.092, catena directăPSORS1C1CDSN: 31.115.087–31.120.446, catena inversăCDSNPSORS1C2: 31.137.534–31.139.721, catena inversăPSORS1C2CCHCR1: 31.142.439–31.158.238, catena inversăTCF19: 31.158.331–31.167.252, catena directăPOU5F1: 31.163.193–31.180.731, catena inversăHLA-C: 31.268.746–31.272.171, catena inversăHLA-CHLA-B: 31.353.195–31.367.067, catena inversăHLA-BMICA: 31.399.784–31.415.315, catena directăMICAMICB: 31.494.881–31.511.124, catena directăMICBMCCD1: 31.528.962–31.530.232, catena directăMCCD1DDX39B: 31.530.217–31.542.451, catena inversăDDX39BATP6V1G2-DDX39B: 31.530.219–31.546.608, catena inversăATP6V1G2-DDX39BATP6V1G2: 31.544.444–31.548.427, catena inversăNFKBIL1: 31.546.870–31.558.829, catena directăLTA: 31.572.054–31.574.324, catena directăTNF: 31.575.558–31.578.336, catena directăTNFLTB: 31.580.525–31.582.522, catena inversăLST1: 31.581.065–31.588.911, catena directăNCR3: 31.588.895–31.593.217, catena inversăAIF1: 31.615.214–31.617.025, catena directăAIF1PRRC2A: 31.620.675–31.637.771, catena directă: 31.622.774–31.622.860, catena directă: 31.623.874–31.625.499, catena directăDiagrama genei PSORS1C1: 6 exoni pe catena directă a cromozomului 6Exon 1: 31.114.800–31.114.891, 92 de bazeExon 2: 31.125.676–31.125.839, 164 de bazeExon 3: 31.129.569–31.129.645, 77 de bazeExon 4: 31.138.430–31.138.459, 30 de bazeExon 5: 31.138.656–31.138.779, 124 de bazeExon 6: 31.139.641–31.140.092, 452 de baze12465′3′

Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.

Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).

Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.

Exonii reprezintă 0,9 kb din cei 25,3 kb ai genei; 459 dintre aceste baze codifică proteina.

Secvenţiere PSORS1C1

1Uşor

Cât de dificil este de secvenţiat PSORS1C1 cu citiri scurte, din 100

Aproape toţi exonii genei PSORS1C1 se află în zone unde citirile scurte se aliniază curat.

Ce se adaugă: ponderea exonilor genei PSORS1C1 din fiecare tip de regiune dificilă

  • Mapabilitate0 %
  • Omologie0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Acoperire de referinţă0 %
  • Repetiţii1,8 %
  • Conţinut GC0 %

Un scor Dante Labs din cercetarea noastră proprie, construit pe hărţile Genome in a Bottle ale NIST pentru regiunile greu de secvenţiat.Cum se calculează scorul

Legături externe

De unde provin aceste date

  • HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
  • MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
  • Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.

Citează această pagină

APA

Dante Labs. (s.a.). Gena PSORS1C1: psoriasis susceptibility 1 candidate 1. Accesat 19 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/psors1c1

Vancouver

Dante Labs. Gena PSORS1C1: psoriasis susceptibility 1 candidate 1 [Internet]. [citat 19 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/psors1c1

Un test. Răspunsuri pentru o viață.

De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni

Comandați Genome Test-ul meu