Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

PSORS1C1

psoriasis susceptibility 1 candidate 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
6p21.33
Koordinater
Kromosom 6: 31 114 800–31 140 092 (GRCh38)
Exoner
6 exoner på 25,3 kb
Protein
152 aminosyror, 16,6 kDa
Även känd som
SEEK1
Tidigare symboler
C6orf16
MANE Select-transkript
ENST00000259881.10NM_014068.3
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser PSORS1C1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är PSORS1C1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 6, med en parentes där PSORS1C1 finns. PSORS1C1 och 41 gener i närheten på kromosom 6, från 30 627 446 till 31 627 445.Kromosom 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2730,8 Mb31 Mb31,2 Mb31,4 Mb31,6 MbATAT1: 30 626 837–30 646 835, framåt-strängATAT1C6orf136: 30 647 003–30 653 225, framåt-strängDHX16: 30 652 469–30 673 059, bakåt-strängDHX16PPP1R18: 30 676 389–30 687 895, bakåt-strängNRM: 30 688 047–30 691 420, bakåt-strängNRMMDC1: 30 699 807–30 717 562, bakåt-strängMDC1TUBB: 30 717 435–30 725 538, framåt-strängTUBBFLOT1: 30 727 709–30 743 075, bakåt-strängFLOT1IER3: 30 743 199–30 744 555, bakåt-strängIER3DDR1: 30 876 421–30 900 978, framåt-strängDDR1GTF2H4: 30 907 517–30 914 119, framåt-strängVARS2: 30 914 205–30 928 614, framåt-strängVARS2SFTA2: 30 931 353–30 955 636, bakåt-strängSFTA2SFTA2-AS1: 30 934 523–30 938 824, framåt-strängSFTA2-AS1MUCL3: 30 940 973–30 954 221, framåt-strängMUCL3MUC21: 30 983 718–30 989 903, framåt-strängMUC21MUC22: 31 010 474–31 036 882, framåt-strängMUC22C6orf15: 31 111 223–31 112 582, bakåt-strängC6orf15PSORS1C1: 31 114 800–31 140 092, framåt-strängPSORS1C1CDSN: 31 115 087–31 120 446, bakåt-strängCDSNPSORS1C2: 31 137 534–31 139 721, bakåt-strängPSORS1C2CCHCR1: 31 142 439–31 158 238, bakåt-strängTCF19: 31 158 331–31 167 252, framåt-strängPOU5F1: 31 163 193–31 180 731, bakåt-strängHLA-C: 31 268 746–31 272 171, bakåt-strängHLA-CHLA-B: 31 353 195–31 367 067, bakåt-strängHLA-BMICA: 31 399 784–31 415 315, framåt-strängMICAMICB: 31 494 881–31 511 124, framåt-strängMICBMCCD1: 31 528 962–31 530 232, framåt-strängMCCD1DDX39B: 31 530 217–31 542 451, bakåt-strängDDX39BATP6V1G2-DDX39B: 31 530 219–31 546 608, bakåt-strängATP6V1G2-DDX39BATP6V1G2: 31 544 444–31 548 427, bakåt-strängNFKBIL1: 31 546 870–31 558 829, framåt-strängLTA: 31 572 054–31 574 324, framåt-strängTNF: 31 575 558–31 578 336, framåt-strängTNFLTB: 31 580 525–31 582 522, bakåt-strängLST1: 31 581 065–31 588 911, framåt-strängNCR3: 31 588 895–31 593 217, bakåt-strängAIF1: 31 615 214–31 617 025, framåt-strängAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, framåt-sträng: 31 622 774–31 622 860, framåt-sträng: 31 623 874–31 625 499, framåt-strängDiagram över PSORS1C1: 6 exoner på framåt-strängen av kromosom 6Exon 1: 31 114 800–31 114 891, 92 baserExon 2: 31 125 676–31 125 839, 164 baserExon 3: 31 129 569–31 129 645, 77 baserExon 4: 31 138 430–31 138 459, 30 baserExon 5: 31 138 656–31 138 779, 124 baserExon 6: 31 139 641–31 140 092, 452 baser12465′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 0,9 kb av genens 25,3 kb, och 459 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av PSORS1C1

1Lätt

Hur svår PSORS1C1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i PSORS1C1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som tillkommer: andelen av PSORS1C1s exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner1,8 %
  • GC-innehåll0 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). PSORS1C1-genen: psoriasis susceptibility 1 candidate 1. Hämtad 21 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/psors1c1

Vancouver

Dante Labs. PSORS1C1-genen: psoriasis susceptibility 1 candidate 1 [Internet]. [citerad 21 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/psors1c1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test