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Gene

ZFYVE16

zinc finger FYVE-type containing 16

Resumo

Localização citogenética
5q14.1
Coordenadas
Cromossoma 5: 80 408 064–80 483 379 (GRCh38)
Exões
19 exões ao longo de 75,3 kb
Proteína
1539 aminoácidos, 168,9 kDa
Também conhecido como
KIAA0305, PPP1R69
Transcrito MANE Select
ENST00000505560.5NM_001284236.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa ZFYVE16 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como ZFYVE16 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 5, com um parêntese onde se situa ZFYVE16. ZFYVE16 e 8 genes próximos no cromossoma 5, de 79 945 722 a 80 945 721.Cromossoma 55q14.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.380 Mb80,2 Mb80,4 Mb80,6 Mb80,8 MbMTX3: 79 976 716–79 991 270, fita inversaMTX3THBS4: 79 991 311–80 084 042, fita diretaTHBS4SERINC5: 80 111 221–80 256 088, fita inversaSERINC5SPZ1: 80 319 625–80 321 842, fita diretaSPZ1ZFYVE16: 80 408 064–80 483 379, fita diretaZFYVE16FAM151B: 80 487 954–80 542 563, fita diretaFAM151BANKRD34B: 80 556 755–80 570 479, fita inversaANKRD34BDHFR: 80 626 226–80 655 002, fita inversaDHFRMSH3: 80 654 613–80 880 295, fita diretaMSH3Diagrama de ZFYVE16: 19 exões na cadeia direta do cromossoma 5Exão 1: 80 408 064–80 408 153, 90 basesExão 2: 80 427 492–80 427 545, 54 basesExão 3: 80 434 109–80 434 217, 109 basesExão 4: 80 436 756–80 439 007, 2252 basesExão 5: 80 439 936–80 440 032, 97 basesExão 6: 80 443 123–80 443 284, 162 basesExão 7: 80 445 263–80 445 405, 143 basesExão 8: 80 448 026–80 448 404, 379 basesExão 9: 80 449 591–80 449 713, 123 basesExão 10: 80 450 431–80 450 586, 156 basesExão 11: 80 451 485–80 451 709, 225 basesExão 12: 80 455 692–80 455 774, 83 basesExão 13: 80 456 461–80 456 565, 105 basesExão 14: 80 456 945–80 457 092, 148 basesExão 15: 80 459 414–80 459 494, 81 basesExão 16: 80 472 761–80 472 923, 163 basesExão 17: 80 473 754–80 473 859, 106 basesExão 18: 80 474 663–80 474 830, 168 basesExão 19: 80 477 219–80 483 379, 6161 bases151015195′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 10,8 kb dos 75,3 kb do gene; 4620 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de ZFYVE16

3Fácil

Grau de dificuldade de sequenciar ZFYVE16 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Quase todos os exões de ZFYVE16 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.

O que acresce: a proporção dos exões de ZFYVE16 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Partilhado com o chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições3%
  • Conteúdo em GC12%

Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene ZFYVE16: zinc finger FYVE-type containing 16. Consultado em 21 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/zfyve16

Vancouver

Dante Labs. Gene ZFYVE16: zinc finger FYVE-type containing 16 [Internet]. [consultado em 21 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/zfyve16

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