Gene
TRMT11
tRNA methyltransferase 11
- HGNC 21080↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000066651↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 60487↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 6q22.32
- Coordenadas
- Cromossoma 6: 125 986 540–126 039 276 (GRCh38)
- Exões
- 13 exões ao longo de 52,7 kb
- Proteína
- 463 aminoácidos
- Também conhecido como
- MDS024, dJ187J11.2, TRM11, TRMT11-1
- Símbolos anteriores
- C6orf75
- Transcrito MANE Select
- ENST00000334379.11NM_001031712.3
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Como TRMT11 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 1,8 kb dos 52,7 kb do gene; 1392 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de TRMT11
2Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar TRMT11 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de TRMT11 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.0,9%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.23%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
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Dante Labs. (s.d.). Gene TRMT11: tRNA methyltransferase 11. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/trmt11
Dante Labs. Gene TRMT11: tRNA methyltransferase 11 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/trmt11
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