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Gene

PPP1R1A

protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1A

Resumo

Localização citogenética
12q13.2
Coordenadas
Cromossoma 12: 54 579 246–54 588 659 (GRCh38)
Exões
7 exões ao longo de 9,4 kb
Proteína
171 aminoácidos
Transcrito MANE Select
ENST00000257905.13NM_006741.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa PPP1R1A ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como PPP1R1A está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
Cromossoma 12, com um parêntese onde se situa PPP1R1A. PPP1R1A e 16 genes próximos no cromossoma 12, de 54 083 953 a 55 083 952.Cromossoma 1212q13.2p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3354,2 Mb54,4 Mb54,6 Mb54,8 Mb55 MbSMUG1: 54 121 277–54 189 008, fita inversaSMUG1CBX5: 54 230 942–54 280 141, fita inversaCBX5HNRNPA1: 54 280 193–54 287 088, fita diretaHNRNPA1NFE2: 54 292 107–54 301 259, fita inversaNFE2COPZ1: 54 301 202–54 351 848, fita diretaCOPZ1GPR84: 54 362 445–54 364 493, fita inversaGPR84ZNF385A: 54 369 129–54 391 338, fita inversaZNF385AITGA5: 54 395 261–54 419 515, fita inversaITGA5GTSF1: 54 455 950–54 473 602, fita inversaGTSF1NCKAP1L: 54 497 713–54 548 243, fita diretaNCKAP1LPDE1B: 54 549 551–54 579 241, fita diretaPDE1BPPP1R1A: 54 579 246–54 588 659, fita inversaPPP1R1ALACRT: 54 630 811–54 634 895, fita inversaLACRTDCD: 54 644 589–54 648 493, fita inversaDCDMUCL1: 54 830 518–54 896 008, fita diretaMUCL1TESPA1: 54 948 015–54 989 104, fita inversaTESPA1NEUROD4: 55 019 968–55 030 017, fita diretaNEUROD4Diagrama de PPP1R1A: 7 exões na cadeia inversa do cromossoma 12Exão 7: 54 579 246–54 580 392, 1147 basesExão 6: 54 580 944–54 581 050, 107 basesExão 5: 54 581 976–54 582 131, 156 basesExão 4: 54 582 732–54 582 795, 64 basesExão 3: 54 583 211–54 583 248, 38 basesExão 2: 54 584 260–54 584 320, 61 basesExão 1: 54 588 405–54 588 659, 255 bases76543215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 1,8 kb dos 9,4 kb do gene; 516 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de PPP1R1A

4Fácil

Grau de dificuldade de sequenciar PPP1R1A com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Quase todos os exões de PPP1R1A se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.

O que acresce: a proporção dos exões de PPP1R1A em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Partilhado com o chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições2,5%
  • Conteúdo em GC14%

Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene PPP1R1A: protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1A. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/ppp1r1a

Vancouver

Dante Labs. Gene PPP1R1A: protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1A [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/ppp1r1a

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