Gene
NXPE4
neurexophilin and PC-esterase domain family member 4
- HGNC 23117↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000137634↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 54827↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 11q23.2
- Coordenadas
- Cromossoma 11: 114 570 591–114 595 786 (GRCh38)
- Exões
- 6 exões ao longo de 25,2 kb
- Proteína
- 544 aminoácidos
- Também conhecido como
- FLJ20127
- Símbolos anteriores
- C11orf33, FAM55D
- Transcrito MANE Select
- ENST00000375478.4NM_001077639.2
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
Esta página como dados
Acrescente .json ao endereço da página, ou peça application/json, para a ler como JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nxpe4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalise NXPE4, e o resto do seu genoma, com um único teste.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas
Obter o meu Genome TestRelatórios com curadoria relevantes para este gene
Nenhum relatório do Genome Test analisa NXPE4 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como NXPE4 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 2,2 kb dos 25,2 kb do gene; 1635 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de NXPE4
1Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar NXPE4 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de NXPE4 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.2,2%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.3,3%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.0%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene NXPE4: neurexophilin and PC-esterase domain family member 4. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/nxpe4
Dante Labs. Gene NXPE4: neurexophilin and PC-esterase domain family member 4 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/nxpe4
Um teste. Respostas para toda a vida.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas