Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

NXPE4

neurexophilin and PC-esterase domain family member 4

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
11q23.2
Koordináták
11. kromoszóma: 114 570 591–114 595 786 (GRCh38)
Exonok
6 exon, összesen 25,2 kb
Fehérje
544 aminosav
Más néven ismert
FLJ20127
Korábbi jelölések
C11orf33, FAM55D
MANE Select transzkriptum
ENST00000375478.4NM_001077639.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) NXPE4 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A NXPE4 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
11. kromoszóma, a NXPE4 helyét zárójel jelöli. A NXPE4 és környékén 8 gén a 11. kromoszómán, 114 083 189–115 083 188 között.11. kromoszóma11q23.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25114,2 Mb114,4 Mb114,6 Mb114,8 Mb115 MbZBTB16: 114 058 335–114 256 765, előre szálZBTB16NNMT: 114 257 765–114 360 039, előre szálNNMTC11orf71: 114 391 443–114 400 511, fordított szálC11orf71RBM7: 114 400 030–114 414 203, előre szálRBM7: 114 400 682–114 443 932, előre szálREXO2: 114 439 359–114 468 149, előre szálREXO2NXPE1: 114 518 842–114 559 888, fordított szálNXPE1NXPE4: 114 570 591–114 595 786, fordított szálNXPE4NXPE2: 114 678 509–114 707 069, előre szálNXPE2A NXPE4 ábrája: 6 exon a(z) 11. kromoszóma fordított szálán6. exon: 114 570 591–114 571 473, 883 bázis5. exon: 114 580 132–114 580 338, 207 bázis4. exon: 114 581 725–114 581 786, 62 bázis3. exon: 114 582 288–114 583 021, 734 bázis2. exon: 114 594 664–114 594 769, 106 bázis1. exon: 114 595 592–114 595 786, 195 bázis6543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 25,2 kb-jából 2,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1635 bázis kódolja a fehérjét.

NXPE4 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a NXPE4 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A NXPE4 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a NXPE4 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség2,2%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,3%
  • GC-tartalom0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). NXPE4 gén: neurexophilin and PC-esterase domain family member 4. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/nxpe4

Vancouver

Dante Labs. NXPE4 gén: neurexophilin and PC-esterase domain family member 4 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/nxpe4

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet