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Gene

LINC00237

long independently transcribed non-coding RNA 237

Resumo

Localização citogenética
20p11.23
Coordenadas
Cromossoma 20: 21 092 809–21 106 358 (GRCh38)
Exões
2 exões ao longo de 13,6 kb
Símbolos anteriores
NCRNA00237
Transcrito MANE Select
ENST00000420705.3NR_190203.1
Tipo de locus
RNA longo não codificante (lncRNA)

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa LINC00237 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como LINC00237 está organizado

  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
Cromossoma 20, com um parêntese onde se situa LINC00237. LINC00237 e 5 genes próximos no cromossoma 20, de 20 599 584 a 21 599 583.Cromossoma 2020p11.23p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3320,6 Mb20,8 Mb21 Mb21,2 Mb21,4 MbRALGAPA2: 20 389 530–20 712 673, fita inversaRALGAPA2LINC00237: 21 092 809–21 106 358, fita inversaLINC00237KIZ: 21 125 975–21 273 506, fita diretaKIZXRN2: 21 303 281–21 390 251, fita diretaXRN2NKX2-4: 21 395 152–21 397 526, fita inversaNKX2-4NKX2-2: 21 511 017–21 514 070, fita inversaNKX2-2Diagrama de LINC00237: 2 exões na cadeia inversa do cromossoma 20Exão 2: 21 092 809–21 093 852, 1044 basesExão 1: 21 106 271–21 106 358, 88 bases215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 1,1 kb dos 13,6 kb do gene.

Sequenciação de LINC00237

2Fácil

Dificuldade de sequenciação de LINC00237 com leituras curtas, em 100

Quase todos os exões de LINC00237 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.

O que acresce: a proporção dos exões de LINC00237 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições0%
  • Conteúdo GC7,8%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene LINC00237: long independently transcribed non-coding RNA 237. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/linc00237

Vancouver

Dante Labs. Gene LINC00237: long independently transcribed non-coding RNA 237 [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/linc00237

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