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Gene

HCAR1

hydroxycarboxylic acid receptor 1

Resumo

Localização citogenética
12q24.31
Coordenadas
Cromossoma 12: 122 726 076–122 730 844 (GRCh38)
Exões
1 exão ao longo de 4,8 kb
Proteína
346 aminoácidos
Também conhecido como
HCA1, FKSG80, TA-GPCR, LACR1
Símbolos anteriores
GPR104, GPR81
Transcrito MANE Select
ENST00000432564.3NM_032554.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa HCAR1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como HCAR1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 12, com um parêntese onde se situa HCAR1. HCAR1 e 17 genes próximos no cromossoma 12, de 122 228 460 a 123 228 459.Cromossoma 1212q24.31p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.33122,4 Mb122,6 Mb122,8 Mb123 Mb123,2 Mb: 122 207 779–122 266 423, fita inversaVPS33A: 122 229 564–122 266 502, fita inversaVPS33ACLIP1: 122 271 432–122 422 778, fita inversaCLIP1ZCCHC8: 122 471 600–122 501 002, fita inversaZCCHC8RSRC2: 122 503 454–122 527 100, fita inversaRSRC2KNTC1: 122 527 246–122 628 182, fita diretaKNTC1HCAR2: 122 701 293–122 703 357, fita inversaHCAR2HCAR3: 122 714 756–122 716 811, fita inversaHCAR3HCAR1: 122 726 076–122 730 844, fita inversaHCAR1DENR: 122 752 824–122 771 394, fita diretaDENRCCDC62: 122 774 517–122 827 528, fita diretaCCDC62HIP1R: 122 834 453–122 862 961, fita diretaHIP1RVPS37B: 122 865 328–122 896 140, fita inversaVPS37BABCB9: 122 918 478–122 981 649, fita inversaABCB9OGFOD2: 122 974 580–122 980 044, fita diretaOGFOD2ARL6IP4: 122 980 045–122 983 480, fita diretaARL6IP4PITPNM2: 122 983 480–123 151 666, fita inversaPITPNM2MPHOSPH9: 123 152 320–123 244 014, fita inversaMPHOSPH9Diagrama de HCAR1: um exão na cadeia inversa do cromossoma 12Exão 1: 122 726 076–122 730 844, 4769 bases15′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 4,8 kb dos 4,8 kb do gene; 1041 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de HCAR1

1Fácil

Grau de dificuldade de sequenciar HCAR1 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Quase todos os exões de HCAR1 se encontram em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.

Fatores que contribuem: a proporção dos exões de HCAR1 em cada tipo de região difícil

  • Mappability0%
  • Homologia0%
  • Repetições3,8%
  • Conteúdo GC0%
  • Cobertura da referência0%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e nos mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene HCAR1: hydroxycarboxylic acid receptor 1. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/hcar1

Vancouver

Dante Labs. Gene HCAR1: hydroxycarboxylic acid receptor 1 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/hcar1

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