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Gene

GRIK3

glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3

Resumo

Localização citogenética
1p34.3
Coordenadas
Cromossoma 1: 36 795 527–37 034 515 (GRCh38)
Exões
16 exões ao longo de 239 kb
Proteína
919 aminoácidos
Também conhecido como
GluK3, GLUR7
Transcrito MANE Select
ENST00000373091.8NM_000831.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa GRIK3 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como GRIK3 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 1, com um parêntese onde se situa GRIK3. GRIK3 e 3 genes próximos no cromossoma 1, de 36 415 021 a 37 415 020.Cromossoma 11p34.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4436,6 Mb36,8 Mb37 Mb37,2 Mb37,4 MbOSCP1: 36 415 273–36 450 491, fita inversaOSCP1MRPS15: 36 455 718–36 464 418, fita inversaMRPS15CSF3R: 36 465 669–36 483 322, fita inversaCSF3RGRIK3: 36 795 527–37 034 515, fita inversaGRIK3Diagrama de GRIK3: 16 exões na cadeia inversa do cromossoma 1Exão 16: 36 795 527–36 802 045, 6519 basesExão 15: 36 804 987–36 805 237, 251 basesExão 14: 36 806 104–36 806 326, 223 basesExão 13: 36 817 060–36 817 277, 218 basesExão 12: 36 819 736–36 819 854, 119 basesExão 11: 36 825 603–36 825 826, 224 basesExão 10: 36 841 736–36 841 939, 204 basesExão 9: 36 850 311–36 850 424, 114 basesExão 8: 36 853 615–36 853 722, 108 basesExão 7: 36 859 108–36 859 251, 144 basesExão 6: 36 859 844–36 860 017, 174 basesExão 5: 36 869 748–36 869 801, 54 basesExão 4: 36 872 188–36 872 369, 182 basesExão 3: 36 880 634–36 880 891, 258 basesExão 2: 36 890 920–36 891 096, 177 basesExão 1: 37 033 994–37 034 515, 522 bases16141210864215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 9,5 kb dos 239 kb do gene; 2760 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de GRIK3

1Fácil

Grau de dificuldade de sequenciar GRIK3 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Quase todos os exões de GRIK3 se encontram em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.

Fatores que contribuem: a proporção dos exões de GRIK3 em cada tipo de região difícil

  • Mappability0%
  • Homologia0%
  • Repetições3,8%
  • Conteúdo GC8,4%
  • Cobertura da referência0%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e nos mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene GRIK3: glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/grik3

Vancouver

Dante Labs. Gene GRIK3: glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/grik3

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