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Gene

CCDC28A

coiled-coil domain containing 28A

Resumo

Localização citogenética
6q24.1
Coordenadas
Cromossoma 6: 138 773 769–138 793 319 (GRCh38)
Exões
6 exões ao longo de 19,6 kb
Proteína
184 aminoácidos
Também conhecido como
CCRL1AP, DKFZp586D0623, LTAP2A
Símbolos anteriores
C6orf80
Transcrito MANE Select
ENST00000617445.5NM_015439.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa CCDC28A ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como CCDC28A está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 6, com um parêntese onde se situa CCDC28A. CCDC28A e 9 genes próximos no cromossoma 6, de 138 283 544 a 139 283 543.Cromossoma 66q24.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27138,4 Mb138,6 Mb138,8 Mb139 Mb139,2 MbARFGEF3: 138 161 692–138 344 663, fita diretaARFGEF3SMIM28: 138 377 905–138 383 486, fita diretaSMIM28HEBP2: 138 403 531–138 422 197, fita diretaHEBP2NHSL1: 138 422 033–138 693 253, fita inversaNHSL1CCDC28A: 138 773 769–138 793 319, fita diretaCCDC28AECT2L: 138 795 911–138 904 711, fita diretaECT2LREPS1: 138 902 982–138 988 356, fita inversaREPS1ABRACL: 139 013 371–139 046 816, fita diretaABRACLHECA: 139 135 064–139 181 921, fita diretaHECATXLNB: 139 239 083–139 291 998, fita inversaTXLNBDiagrama de CCDC28A: 6 exões na cadeia direta do cromossoma 6Exão 1: 138 773 769–138 773 902, 134 basesExão 2: 138 776 079–138 776 278, 200 basesExão 3: 138 779 822–138 779 985, 164 basesExão 4: 138 785 227–138 785 381, 155 basesExão 5: 138 788 366–138 788 388, 23 basesExão 6: 138 792 749–138 793 319, 571 bases1234565′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 1,2 kb dos 19,6 kb do gene; 555 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de CCDC28A

2Fácil

Dificuldade de sequenciação de CCDC28A com leituras curtas, em 100

Quase todos os exões de CCDC28A se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.

O que acresce: a proporção dos exões de CCDC28A em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Repetições6,3%
  • Conteúdo GC11%
  • Cobertura da referência0%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene CCDC28A: coiled-coil domain containing 28A. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/ccdc28a

Vancouver

Dante Labs. Gene CCDC28A: coiled-coil domain containing 28A [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/ccdc28a

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