Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

ERVH48-1

endogenous retrovirus group 48 member 1, envelope

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
21q22.3
Współrzędne
Chromosom 21: 42 916 803–42 925 630 (GRCh38)
Eksony
2 eksonów na odcinku 8,8 kb
Białko
160 aminokwasów
Znany również jako
SUPYN, HERV-Fb1
Poprzednie symbole
C21orf105, NDUFV3-AS1
Transkrypt MANE Select
ENST00000447535.2NM_001308491.2
Typ locus
Endogenny retrowirus
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu ERVH48-1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu ERVH48-1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 21, z nawiasem wskazującym położenie ERVH48-1. ERVH48-1 i 11 genów w pobliżu na chromosomie 21, od 42 421 217 do 43 421 216.Chromosom 2121q22.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.342,6 Mb42,8 Mb43 Mb43,2 Mb43,4 MbUBASH3A: 42 403 447–42 447 684, nić dodatniejUBASH3ARSPH1: 42 472 486–42 496 366, nić ujemnejRSPH1SLC37A1: 42 495 994–42 581 440, nić dodatniejSLC37A1PDE9A: 42 653 584–42 776 512, nić dodatniejPDE9AWDR4: 42 843 013–42 879 583, nić ujemnejWDR4NDUFV3: 42 879 644–42 913 304, nić dodatniejNDUFV3ERVH48-1: 42 916 803–42 925 630, nić ujemnejERVH48-1PKNOX1: 42 974 328–43 034 494, nić dodatniejPKNOX1CBS: 43 050 900–43 076 943, nić ujemnejCBSU2AF1: 43 092 956–43 107 605, nić ujemnejU2AF1CRYAA: 43 169 008–43 172 810, nić dodatniejCRYAASIK1: 43 414 483–43 427 137, nić ujemnejSIK1Schemat ERVH48-1: 2 eksonów na nici ujemnej chromosomu 21Ekson 2: 42 916 803–42 919 291, 2489 zasadEkson 1: 42 925 346–42 925 630, 285 zasad215′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 2,8 kb z 8,8 kb genu; 483 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie ERVH48-1

32Umiarkowanie

Jak trudno zsekwencjonować ERVH48-1 krótkimi odczytami, w skali do 100

Część eksonów ERVH48-1 znajduje się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub przypisać ją w niewłaściwym miejscu.

Co na to wpływa: udział eksonów ERVH48-1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność0,1%
  • Homologia53%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia1,4%
  • Zawartość GC0%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen ERVH48-1: endogenous retrovirus group 48 member 1, envelope. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ervh48-1

Vancouver

Dante Labs. Gen ERVH48-1: endogenous retrovirus group 48 member 1, envelope [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ervh48-1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test