Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

HLA-DQA2

major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 2

Samenvatting

Cytogenetische locatie
6p21.32
Coördinaten
Chromosoom 6: 32.741.391–32.747.198 (GRCh38)
Exons
5 exons over 5,8 kb
Eiwit
255 aminozuren
Eerdere symbolen
HLA-DXA
MANE Select-transcript
ENST00000374940.4NM_020056.5
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest HLA-DQA2 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van HLA-DQA2

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 6, met een haakje waar HLA-DQA2 zich bevindt. HLA-DQA2 en 26 genen in de buurt op chromosoom 6, van 32.244.295 tot 33.244.294.Chromosoom 66p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2732,4 Mb32,6 Mb32,8 Mb33 Mb33,2 MbTSBP1: 32.288.526–32.371.907, omgekeerde-strengTSBP1BTNL2: 32.391.481–32.407.181, omgekeerde-strengBTNL2HLA-DRA: 32.439.870–32.445.181, voorwaartse-strengHLA-DRAHLA-DRB5: 32.516.622–32.530.369, omgekeerde-strengHLA-DRB5HLA-DRB1: 32.577.902–32.589.848, omgekeerde-strengHLA-DRB1HLA-DQA1: 32.628.179–32.659.533, voorwaartse-strengHLA-DQA1HLA-DQB1: 32.640.622–32.668.383, omgekeerde-strengHLA-DQB1HLA-DQA2: 32.741.391–32.747.198, voorwaartse-strengHLA-DQA2HLA-DQB2: 32.756.094–32.763.563, omgekeerde-strengHLA-DQB2HLA-DOB: 32.812.763–32.820.466, omgekeerde-strengHLA-DOB: 32.813.767–32.838.822, omgekeerde-strengTAP2: 32.821.833–32.838.802, omgekeerde-strengTAP2PSMB8: 32.840.717–32.844.679, omgekeerde-strengPSMB8PSMB9: 32.844.136–32.882.881, voorwaartse-strengTAP1: 32.845.204–32.854.026, omgekeerde-strengHLA-DMB: 32.929.338–32.941.490, omgekeerde-strengHLA-DMB: 32.937.364–32.953.122, omgekeerde-strengHLA-DMA: 32.948.613–32.969.094, omgekeerde-strengHLA-DMABRD2: 32.968.564–32.981.505, voorwaartse-strengBRD2HLA-DOA: 33.004.178–33.009.617, omgekeerde-strengHLA-DOAHLA-DPA1: 33.064.569–33.080.781, omgekeerde-strengHLA-DPA1HLA-DPB1: 33.073.786–33.091.655, voorwaartse-strengHLA-DPB1COL11A2: 33.162.681–33.192.802, omgekeerde-strengCOL11A2RXRB: 33.193.585–33.200.693, omgekeerde-strengRXRBSLC39A7: 33.200.305–33.204.439, voorwaartse-strengSLC39A7HSD17B8: 33.204.631–33.206.831, voorwaartse-strengHSD17B8RING1: 33.208.033–33.212.722, voorwaartse-strengDiagram van HLA-DQA2: 5 exons op de voorwaartse streng van chromosoom 6Exon 1: 32.741.391–32.741.525, 135 basenExon 2: 32.745.159–32.745.407, 249 basenExon 3: 32.745.791–32.746.072, 282 basenExon 4: 32.746.240–32.746.414, 175 basenExon 5: 32.746.582–32.747.198, 617 basen123455′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 1,5 kb van de 5,8 kb van het gen; 768 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing HLA-DQA2

5Makkelijk

Hoe moeilijk HLA-DQA2 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100

Bijna alle exonen van HLA-DQA2 liggen op plaatsen waar korte reads schoon in kaart worden gebracht.

Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van HLA-DQA2 in elk soort moeilijke regio

  • Mappability12%
  • Homologie0%
  • Herhalingen2,9%
  • GC-gehalte0%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). HLA-DQA2-gen: major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 2. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/hla-dqa2

Vancouver

Dante Labs. HLA-DQA2-gen: major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 2 [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/hla-dqa2

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen