İçeriğe atla
HSA veya FSA fonlarınızı kullanın
Genomunuzu dizileyin (yeni sekmede açılır)

Gen

HLA-DQA2

major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 2

Özet

Sitogenetik konum
6p21.32
Koordinatlar
Kromozom 6: 32.741.391–32.747.198 (GRCh38)
Eksonlar
5,8 kb boyunca 5 ekson
Protein
255 amino asit
Önceki semboller
HLA-DXA
MANE Select transkripti
ENST00000374940.4NM_020056.5
Lokus türü
Protein kodlayan
  • Çok yüksek
  • Yüksek
  • Düşük
  • Çok düşük

Bu gen için derlenmiş ilgili raporlar

Hiçbir Genome Test raporu HLA-DQA2 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.

HLA-DQA2 geninin yapısı

  • Kodlayan dizi
  • Çevrilmeyen bölge
  • İntron
  • Transkripsiyon yönü
  • Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Kromozom 6, HLA-DQA2 genin yerini gösteren köşeli parantezle. HLA-DQA2 ve yakınındaki 26 gen, kromozom 6 üzerinde, 32.244.295 ile 33.244.294 arasında.Kromozom 66p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2732,4 Mb32,6 Mb32,8 Mb33 Mb33,2 MbTSBP1: 32.288.526–32.371.907, geri iplikTSBP1BTNL2: 32.391.481–32.407.181, geri iplikBTNL2HLA-DRA: 32.439.870–32.445.181, ileri iplikHLA-DRAHLA-DRB5: 32.516.622–32.530.369, geri iplikHLA-DRB5HLA-DRB1: 32.577.902–32.589.848, geri iplikHLA-DRB1HLA-DQA1: 32.628.179–32.659.533, ileri iplikHLA-DQA1HLA-DQB1: 32.640.622–32.668.383, geri iplikHLA-DQB1HLA-DQA2: 32.741.391–32.747.198, ileri iplikHLA-DQA2HLA-DQB2: 32.756.094–32.763.563, geri iplikHLA-DQB2HLA-DOB: 32.812.763–32.820.466, geri iplikHLA-DOB: 32.813.767–32.838.822, geri iplikTAP2: 32.821.833–32.838.802, geri iplikTAP2PSMB8: 32.840.717–32.844.679, geri iplikPSMB8PSMB9: 32.844.136–32.882.881, ileri iplikTAP1: 32.845.204–32.854.026, geri iplikHLA-DMB: 32.929.338–32.941.490, geri iplikHLA-DMB: 32.937.364–32.953.122, geri iplikHLA-DMA: 32.948.613–32.969.094, geri iplikHLA-DMABRD2: 32.968.564–32.981.505, ileri iplikBRD2HLA-DOA: 33.004.178–33.009.617, geri iplikHLA-DOAHLA-DPA1: 33.064.569–33.080.781, geri iplikHLA-DPA1HLA-DPB1: 33.073.786–33.091.655, ileri iplikHLA-DPB1COL11A2: 33.162.681–33.192.802, geri iplikCOL11A2RXRB: 33.193.585–33.200.693, geri iplikRXRBSLC39A7: 33.200.305–33.204.439, ileri iplikSLC39A7HSD17B8: 33.204.631–33.206.831, ileri iplikHSD17B8RING1: 33.208.033–33.212.722, ileri iplikHLA-DQA2 şeması: kromozom 6 üzerinde ileri yönde 5 eksonEkson 1: 32.741.391–32.741.525, 135 bazEkson 2: 32.745.159–32.745.407, 249 bazEkson 3: 32.745.791–32.746.072, 282 bazEkson 4: 32.746.240–32.746.414, 175 bazEkson 5: 32.746.582–32.747.198, 617 baz123455′3′

Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.

Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).

Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.

Ekzonlar genin 5,8 kb uzunluğunun 1,5 kb'sini oluşturur; bu bazların 768 tanesi proteini kodlar.

HLA-DQA2 dizilemesi

5Kolay

Kısa okumalarla HLA-DQA2 dizilemesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden

HLA-DQA2 geninin ekzonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşleştiği yerlerde bulunuyor.

Buna katkıda bulunan etken: HLA-DQA2 geninin ekzonlarının her zorluk türündeki bölgelerde bulunan oranı

  • Eşlenebilirlik%12
  • Homoloji%0
  • Tekrarlar%2,9
  • GC içeriği%0
  • Referans kapsamı%0

Dante Labs'ın kendi araştırmasına dayanan bir Dante Labs puanı; NIST'in zor dizilenen bölgelere ilişkin Genome in a Bottle haritalarına dayanır.Puan nasıl hesaplanır

Dış bağlantılar

Bilgilerin kaynağı

  • HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
  • NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
  • NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.

Bu sayfayı alıntıla

APA

Dante Labs. (t.y.). HLA-DQA2 geni: major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 2. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/hla-dqa2

Vancouver

Dante Labs. HLA-DQA2 geni: major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 2 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/hla-dqa2

Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.

$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde

Genome Test'imi al