Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

GJD3

gap junction protein delta 3

Samenvatting

Cytogenetische locatie
17q21.2
Coördinaten
Chromosoom 17: 40.360.652–40.364.737 (GRCh38)
Exons
1 exon over 4,1 kb
Eiwit
294 aminozuren
Ook bekend als
CX31.9, GJA11, Cx30.2
Eerdere symbolen
GJC1
MANE Select-transcript
ENST00000578689.2NM_152219.4
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest GJD3 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van GJD3

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
Chromosoom 17, met een haakje waar GJD3 zich bevindt. GJD3 en 31 genen in de buurt op chromosoom 17, van 39.862.695 tot 40.862.694.Chromosoom 1717q21.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.340 Mb40,2 Mb40,4 Mb40,6 Mb40,8 MbIKZF3: 39.757.715–39.864.368, omgekeerde-strengIKZF3ZPBP2: 39.868.202–39.877.896, voorwaartse-strengZPBP2GSDMB: 39.904.595–39.919.854, omgekeerde-strengGSDMBORMDL3: 39.919.927–39.982.186, omgekeerde-strengORMDL3LRRC3C: 39.927.725–39.946.538, voorwaartse-strengLRRC3CGSDMA: 39.953.263–39.977.875, voorwaartse-strengGSDMAPSMD3: 39.980.800–39.997.960, voorwaartse-strengPSMD3CSF3: 40.015.361–40.017.816, voorwaartse-strengCSF3MED24: 40.019.097–40.061.215, omgekeerde-strengMED24THRA: 40.058.290–40.093.867, voorwaartse-strengTHRANR1D1: 40.092.793–40.100.630, omgekeerde-strengNR1D1MSL1: 40.121.637–40.136.935, voorwaartse-strengMSL1CASC3: 40.140.278–40.177.001, voorwaartse-strengCASC3RAPGEFL1: 40.177.010–40.195.656, voorwaartse-strengRAPGEFL1WIPF2: 40.218.743–40.284.136, voorwaartse-strengWIPF2CDC6: 40.287.831–40.304.657, voorwaartse-strengCDC6RARA: 40.309.165–40.357.643, voorwaartse-strengRARAGJD3: 40.360.652–40.364.737, omgekeerde-strengGJD3TOP2A: 40.388.521–40.417.941, omgekeerde-strengTOP2AIGFBP4: 40.442.913–40.460.822, voorwaartse-strengIGFBP4TNS4: 40.475.828–40.501.630, omgekeerde-strengTNS4CCR7: 40.551.081–40.565.478, omgekeerde-strengCCR7SMARCE1: 40.624.962–40.648.667, omgekeerde-strengSMARCE1: 40.627.356–40.665.141, omgekeerde-strengKRT222: 40.654.665–40.665.181, omgekeerde-strengKRT222KRT24: 40.697.991–40.703.758, omgekeerde-strengKRT24KRT25: 40.748.021–40.755.331, omgekeerde-strengKRT25KRT26: 40.766.238–40.772.201, omgekeerde-strengKRT26KRT27: 40.776.808–40.782.550, omgekeerde-strengKRT27KRT28: 40.792.196–40.799.959, omgekeerde-strengKRT28KRT10: 40.817.784–40.822.614, omgekeerde-strengKRT10KRT12: 40.860.943–40.867.223, omgekeerde-strengKRT12Diagram van GJD3: één exon op de omgekeerde streng van chromosoom 17Exon 1: 40.360.652–40.364.737, 4.086 basen15′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 4,1 kb van de 4,1 kb van het gen; 885 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing van GJD3

5Makkelijk

Hoe moeilijk GJD3 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100

Vrijwel alle exons van GJD3 liggen waar korte reads zich goed laten plaatsen.

Wat dit verder beïnvloedt: het aandeel van de exons van GJD3 in elk type moeilijke regio

  • Mappability0%
  • Homologie0%
  • Repeats3,3%
  • GC-gehalte49%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs uit ons eigen onderzoek, gebaseerd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt de score berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). GJD3-gen: gap junction protein delta 3. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/gjd3

Vancouver

Dante Labs. GJD3-gen: gap junction protein delta 3 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/gjd3

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen