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Gene

NUTF2

nuclear transport factor 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
16q22.1
Coordinate
Cromosoma 16: 67.846.933–67.872.567 (GRCh38)
Esoni
5 esoni su 25,6 kb
Proteina
127 amminoacidi
Noto anche come
NTF2, PP15
Trascritto MANE Select
ENST00000219169.9NM_005796.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora NUTF2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di NUTF2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 16, con una parentesi dove si trova NUTF2. NUTF2 e 38 geni nelle vicinanze sul cromosoma 16, da 67.359.750 a 68.359.749.Cromosoma 1616q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.367,4 Mb67,6 Mb67,8 Mb68 Mb68,2 MbLRRC36: 67.326.798–67.385.221, filamento direttoLRRC36TPPP3: 67.389.027–67.393.518, filamento inversoTPPP3ZDHHC1: 67.394.152–67.416.833, filamento inversoZDHHC1HSD11B2: 67.430.652–67.437.553, filamento direttoHSD11B2ATP6V0D1: 67.437.523–67.481.227, filamento inversoATP6V0D1AGRP: 67.482.571–67.483.552, filamento inversoAGRPRIPOR1: 67.518.418–67.546.788, filamento direttoRIPOR1CTCF: 67.561.831–67.639.189, filamento direttoCARMIL2: 67.644.988–67.657.569, filamento direttoACD: 67.657.512–67.660.810, filamento inversoPARD6A: 67.660.350–67.664.266, filamento direttoPARD6AENKD1: 67.662.945–67.667.954, filamento inversoENKD1C16orf86: 67.666.802–67.668.757, filamento direttoC16orf86GFOD2: 67.674.527–67.719.352, filamento inversoGFOD2RANBP10: 67.723.070–67.806.563, filamento inversoRANBP10TSNAXIP1: 67.806.765–67.832.148, filamento direttoCENPT: 67.828.157–67.847.811, filamento inversoCENPTTHAP11: 67.842.320–67.844.195, filamento direttoTHAP11NUTF2: 67.846.933–67.872.567, filamento direttoNUTF2EDC4: 67.873.049–67.884.520, filamento direttoEDC4NRN1L: 67.884.868–67.888.855, filamento direttoPSKH1: 67.893.244–67.929.676, filamento direttoPSKH1CTRL: 67.927.640–67.932.365, filamento inversoCTRL: 67.929.614–67.936.017, filamento inversoPSMB10: 67.934.504–67.936.865, filamento inversoPSMB10LCAT: 67.939.150–67.944.681, filamento inversoSLC12A4: 67.943.474–67.969.601, filamento inversoDPEP3: 67.975.661–67.980.554, filamento inversoDPEP3DPEP2: 67.987.392–68.000.624, filamento inversoDPEP2DUS2: 67.987.746–68.079.344, filamento direttoDPEP2NB: 68.013.436–68.015.911, filamento inversoDPEP2NBDDX28: 68.020.916–68.023.232, filamento inversoDDX28NFATC3: 68.084.751–68.229.259, filamento direttoNFATC3ESRP2: 68.225.974–68.238.102, filamento inversoESRP2PLA2G15: 68.245.304–68.261.063, filamento direttoPLA2G15SLC7A6: 68.264.173–68.301.853, filamento direttoSLC7A6SLC7A6OS: 68.284.498–68.310.968, filamento inversoSLC7A6OSPRMT7: 68.310.916–68.360.852, filamento direttoPRMT7SMPD3: 68.358.327–68.448.550, filamento inversoSMPD3Diagramma di NUTF2: 5 esoni sul filamento diretto del cromosoma 16Esone 1: 67.846.933–67.846.985, 53 basiEsone 2: 67.865.102–67.865.229, 128 basiEsone 3: 67.868.340–67.868.411, 72 basiEsone 4: 67.868.501–67.868.599, 99 basiEsone 5: 67.870.800–67.872.567, 1768 basi12455′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,1 kb dei 25,6 kb del gene; 384 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di NUTF2

1Bassa

Quanto è difficile sequenziare NUTF2 con letture corte, su 100

  • Mappabilità1,3%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni1,5%
  • Contenuto di GC2,5%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene NUTF2: nuclear transport factor 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/nutf2

Vancouver

Dante Labs. Gene NUTF2: nuclear transport factor 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/nutf2

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