Gene
KL
klotho
- HGNC 6344↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000133116↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 9365↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 13q13.1
- Coordinate
- Cromosoma 13: 33.016.423–33.066.143 (GRCh38)
- Esoni
- 5 esoni su 49,7 kb
- Proteina
- 1012 amminoacidi
- Noto anche come
- KLA
- Trascritto MANE Select
- ENST00000380099.4NM_004795.4
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Questa pagina come dati
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Nessun report del Genome Test legge ancora KL. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di KL
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 5 kb dei 49,7 kb del gene; 3039 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento KL
3Facile
Quanto è difficile sequenziare KL con letture corte, su 100
0 · Facile100 · Difficile
Quasi tutti gli esoni di KL si trovano in punti in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.
Cosa aggrava il quadro: la quota degli esoni di KL in ciascun tipo di regione difficile
- MappabilitàTratti in cui letture di 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, per cui una chiamata in quel punto può mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una sola base, su cui le letture scivolano e che potrebbero non coprire per intero. Peso 15%.1,1%
- Contenuto GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre in modo scarso. Peso 10%.33%
- Copertura del riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento nelle vicinanze, dove non c'è sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Un punteggio Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare Genome in a Bottle del NIST.Come viene calcolato il punteggioOgni barra indica la quota delle basi esoniche di KL in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in alcuna regione, 100 quando ogni base si trova in tutte.
2
posizioni in KL in cui ClinVar classifica una variazione come patogenica o probabilmente patogenica
Nessuna di esse ricade in una regione difficile da leggere con letture corte.
Un genoma intero copre tutti i 49,7 kb di KL, introni inclusi, e non solo i 5 kb di esoni.
ClinVar pathogenic variants (2)
The KL variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Probabilmente patogena 2
| Variante | Conditions | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|
| NM_004795.4(KL):c.242_245dup (p.His83fs) (opens in a new tab) | tumoral calcinosis, hyperphosphatemic, familial, 3 | Probabilmente patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
| NM_004795.4(KL):c.578A>G (p.His193Arg) (opens in a new tab) | tumoral calcinosis, hyperphosphatemic, familial, 3 | Probabilmente patogena | ★★★★1 stella su 4 criteri forniti, singolo sottomittente |
Tratti collegati a KL
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che KL può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: i siti noti che causano malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene KL: klotho. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/kl
Dante Labs. Gene KL: klotho [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/kl
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