Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SNU13

small nuclear ribonucleoprotein 13

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
22q13.2
Koordináták
22. kromoszóma: 41 673 933–41 688 867 (GRCh38)
Exonok
3 exon, összesen 14,9 kb
Fehérje
128 aminosav
Más néven ismert
FA-1, SPAG12, SNRNP15-5, 15.5K
Korábbi jelölések
SSFA1, NHP2L1
MANE Select transzkriptum
ENST00000401959.6NM_001003796.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SNU13 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SNU13 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
22. kromoszóma, a SNU13 helyét zárójel jelöli. A SNU13 és környékén 29 gén a 22. kromoszómán, 41 181 400–42 181 399 között.22. kromoszóma22q13.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3341,2 Mb41,4 Mb41,6 Mb41,8 Mb42 MbL3MBTL2: 41 205 282–41 231 623, előre szálL3MBTL2CHADL: 41 229 256–41 241 000, fordított szálCHADLRANGAP1: 41 243 474–41 302 744, fordított szálRANGAP1ZC3H7B: 41 301 457–41 360 155, előre szálZC3H7BTEF: 41 367 333–41 399 326, előre szálTEFTOB2: 41 433 489–41 447 602, fordított szálTOB2ACO2: 41 447 830–41 529 273, előre szálACO2PHF5A: 41 448 895–41 468 713, fordított szálPHF5APOLR3H: 41 525 799–41 544 606, fordított szálPOLR3HCSDC2: 41 560 758–41 577 741, előre szálCSDC2PMM1: 41 576 886–41 595 275, fordított szálPMM1DESI1: 41 598 028–41 621 089, fordított szálDESI1XRCC6: 41 620 786–41 664 087, előre szálXRCC6SNU13: 41 673 933–41 688 867, fordított szálSNU13MEI1: 41 699 494–41 799 456, előre szálMEI1CCDC134: 41 800 321–41 832 178, előre szálCCDC134SREBF2: 41 833 029–41 907 308, előre szálSREBF2SHISA8: 41 906 316–41 915 129, fordított szálSHISA8TNFRSF13C: 41 922 032–41 926 806, fordított szálTNFRSF13CCENPM: 41 927 514–41 947 183, fordított szálCENPMSMIM45: 41 947 178–41 958 942, előre szálSMIM45SEPTIN3: 41 969 443–41 998 221, előre szálSEPTIN3WBP2NL: 41 998 725–42 058 456, előre szálWBP2NLNAGA: 42 032 595–42 071 198, fordított szálNAGAPHETA2: 42 073 789–42 079 439, előre szálPHETA2SMDT1: 42 079 564–42 090 033, előre szálSMDT1NDUFA6: 42 080 336–42 090 884, fordított szálCYP2D6: 42 120 962–42 131 727, fordított szálCYP2D6CYP2D7: 42 140 203–42 149 500, fordított szálCYP2D7TCF20: 42 160 013–42 343 616, fordított szálTCF20A SNU13 ábrája: 3 exon a(z) 22. kromoszóma fordított szálán3. exon: 41 673 933–41 675 195, 1263 bázis2. exon: 41 680 244–41 680 364, 121 bázis1. exon: 41 688 794–41 688 867, 74 bázis3215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 14,9 kb-jából 1,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 387 bázis kódolja a fehérjét.

SNU13 szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a SNU13 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A SNU13 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a SNU13 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések0,1%
  • GC-tartalom5,1%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SNU13 gén: small nuclear ribonucleoprotein 13. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/snu13

Vancouver

Dante Labs. SNU13 gén: small nuclear ribonucleoprotein 13 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/snu13

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet