Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LMTK1

lemur tail kinase 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q25.3
Koordináták
17. kromoszóma: 81 117 295–81 166 221 (GRCh38)
Exonok
14 exon, összesen 48,9 kb
Fehérje
1374 aminosav
Más néven ismert
AATYK, KIAA0641, LMR1, AATYK1, PPP1R77
Korábbi jelölések
AATK
MANE Select transzkriptum
ENST00000326724.9NM_001080395.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LMTK1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LMTK1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a LMTK1 helyét zárójel jelöli. A LMTK1 és környékén 14 gén a 17. kromoszómán, 80 641 758–81 641 757 között.17. kromoszóma17q25.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.380,8 Mb81 Mb81,2 Mb81,4 Mb81,6 MbRPTOR: 80 544 819–80 966 371, előre szálRPTORCHMP6: 80 991 598–81 031 356, előre szálCHMP6BAIAP2: 81 035 122–81 117 434, előre szálBAIAP2LMTK1: 81 117 295–81 166 221, fordított szálLMTK1PVALEF: 81 165 507–81 183 166, előre szálPVALEFCEP131: 81 189 583–81 223 014, fordított szálCEP131TEPSIN: 81 228 277–81 239 095, fordított szálTEPSINNDUFAF8: 81 239 305–81 241 310, előre szálNDUFAF8SLC38A10: 81 244 811–81 295 567, fordított szálSLC38A10BAHCC1: 81 395 450–81 466 331, előre szálBAHCC1ACTG1: 81 509 413–81 523 847, fordított szálACTG1FSCN2: 81 528 372–81 542 415, előre szálFSCN2FAAP100: 81 539 885–81 553 961, fordított szálFAAP100NPLOC4: 81 556 887–81 648 465, fordított szálNPLOC4TSPAN10: 81 637 171–81 648 754, előre szálTSPAN10A LMTK1 ábrája: 14 exon a(z) 17. kromoszóma fordított szálán14. exon: 81 117 295–81 118 442, 1148 bázis13. exon: 81 119 380–81 119 580, 201 bázis12. exon: 81 119 936–81 120 083, 148 bázis11. exon: 81 120 201–81 122 823, 2623 bázis10. exon: 81 123 194–81 123 343, 150 bázis9. exon: 81 124 727–81 124 848, 122 bázis8. exon: 81 124 930–81 125 014, 85 bázis7. exon: 81 126 427–81 126 560, 134 bázis6. exon: 81 127 583–81 127 670, 88 bázis5. exon: 81 127 792–81 127 910, 119 bázis4. exon: 81 128 470–81 128 549, 80 bázis3. exon: 81 131 061–81 131 205, 145 bázis2. exon: 81 134 368–81 134 501, 134 bázis1. exon: 81 165 938–81 166 221, 284 bázis141210864215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 48,9 kb-jából 5,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4125 bázis kódolja a fehérjét.

LMTK1 szekvenálása

21Közepes

Mennyire nehéz a LMTK1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A LMTK1 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a LMTK1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések5,1%
  • GC-tartalom97%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LMTK1 gén: lemur tail kinase 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lmtk1

Vancouver

Dante Labs. LMTK1 gén: lemur tail kinase 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lmtk1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet