Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

IFFO1

intermediate filament family orphan 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
12p13.31
Koordináták
12. kromoszóma: 6 539 539–6 556 042 (GRCh38)
Exonok
10 exon, összesen 16,5 kb
Fehérje
571 aminosav
Más néven ismert
HOM-TES-103
Korábbi jelölések
IFFO
MANE Select transzkriptum
ENST00000619571.5NM_001193457.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) IFFO1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A IFFO1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
12. kromoszóma, a IFFO1 helyét zárójel jelöli. A IFFO1 és környékén 43 gén a 12. kromoszómán, 6 047 791–7 047 790 között.12. kromoszóma12p13.31p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.336,2 Mb6,4 Mb6,6 Mb6,8 Mb7 MbVWF: 5 948 877–6 124 770, fordított szálVWFCD9: 6 199 715–6 238 271, előre szálCD9PLEKHG6: 6 310 167–6 328 934, előre szálPLEKHG6TNFRSF1A: 6 328 757–6 342 114, fordított szálTNFRSF1ASCNN1A: 6 345 124–6 383 917, fordított szálSCNN1ALTBR: 6 375 045–6 391 571, előre szálLTBRCD27: 6 444 933–6 451 718, előre szálCD27TAPBPL: 6 451 690–6 466 517, előre szálTAPBPLVAMP1: 6 462 237–6 470 948, fordított szálVAMP1MRPL51: 6 490 204–6 493 856, fordított szálMRPL51NCAPD2: 6 493 356–6 531 970, előre szálNCAPD2GAPDH: 6 534 012–6 538 930, előre szálGAPDHIFFO1: 6 539 539–6 556 042, fordított szálIFFO1NOP2: 6 556 863–6 568 691, fordított szálNOP2: 6 556 886–6 607 367, fordított szálCHD4: 6 570 081–6 614 982, fordított szálCHD4LPAR5: 6 618 835–6 636 444, fordított szálLPAR5ACRBP: 6 638 075–6 647 441, fordított szálACRBPING4: 6 650 282–6 663 180, fordított szálING4ZNF384: 6 665 037–6 689 572, fordított szálZNF384PIANP: 6 693 791–6 700 859, fordított szálPIANPCOPS7A: 6 724 014–6 732 462, előre szálCOPS7AMLF2: 6 747 986–6 768 932, fordított szálMLF2PTMS: 6 765 516–6 770 952, előre szálPTMSLAG3: 6 772 360–6 778 455, előre szálLAG3CD4: 6 786 858–6 820 807, előre szálCD4GPR162: 6 821 624–6 829 972, előre szálGPR162P3H3: 6 828 220–6 839 867, előre szálP3H3GNB3: 6 839 954–6 847 393, előre szálGNB3CDCA3: 6 844 723–6 852 353, fordított szálUSP5: 6 852 098–6 866 632, előre szálTPI1: 6 867 119–6 878 513, előre szálSPSB2: 6 870 934–6 889 358, fordított szálLRRC23: 6 873 455–6 914 243, előre szálLRRC23ENO2: 6 913 745–6 923 970, előre szálENO2ATN1: 6 924 454–6 942 322, előre szálATN1C12orf57: 6 942 919–6 946 009, előre szálRNU7-1: 6 943 816–6 943 878, előre szálRNU7-1PTPN6: 6 946 417–6 961 316, előre szálPTPN6PHB2: 6 965 327–6 970 841, fordított szálEMG1: 6 970 765–6 979 939, előre szál: 6 970 921–6 997 428, előre szálLPCAT3: 6 972 027–7 018 779, fordított szálC1S: 6 988 259–7 071 281, előre szálC1SA IFFO1 ábrája: 10 exon a(z) 12. kromoszóma fordított szálán10. exon: 6 539 539–6 540 588, 1050 bázis9. exon: 6 541 512–6 541 642, 131 bázis8. exon: 6 548 065–6 548 160, 96 bázis7. exon: 6 548 425–6 548 545, 121 bázis6. exon: 6 548 668–6 548 849, 182 bázis5. exon: 6 549 476–6 549 484, 9 bázis4. exon: 6 549 756–6 549 896, 141 bázis3. exon: 6 550 695–6 550 790, 96 bázis2. exon: 6 550 941–6 551 001, 61 bázis1. exon: 6 555 257–6 556 042, 786 bázis10864215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 16,5 kb-jából 2,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1716 bázis kódolja a fehérjét.

IFFO1 szekvenálása

11Könnyű

Mennyire nehéz a IFFO1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A IFFO1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a IFFO1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések4,1%
  • GC-tartalom51%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). IFFO1 gén: intermediate filament family orphan 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/iffo1

Vancouver

Dante Labs. IFFO1 gén: intermediate filament family orphan 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/iffo1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet