Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ICAM1

intercellular adhesion molecule 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19p13.2
Koordináták
19. kromoszóma: 10 271 120–10 286 615 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 15,5 kb
Fehérje
532 aminosav
Más néven ismert
BB2, CD54
MANE Select transzkriptum
ENST00000264832.8NM_000201.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ICAM1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ICAM1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a ICAM1 helyét zárójel jelöli. A ICAM1 és környékén 37 gén a 19. kromoszómán, 9 778 868–10 778 867 között.19. kromoszóma19p13.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.439,8 Mb10 Mb10,2 Mb10,4 Mb10,6 MbZNF846: 9 749 546–9 793 180, fordított szálZNF846FBXL12: 9 810 267–9 827 816, fordított szálFBXL12UBL5: 9 827 887–9 830 369, előre szálUBL5PIN1: 9 835 257–9 849 690, előre szálPIN1OLFM2: 9 853 717–9 936 559, fordított szálOLFM2COL5A3: 9 959 561–10 010 511, fordított szálCOL5A3RDH8: 10 013 249–10 022 279, előre szálRDH8SHFL: 10 086 017–10 093 252, előre szálANGPTL6: 10 092 335–10 106 612, fordított szálPPAN-P2RY11: 10 106 223–10 114 780, előre szálPPAN-P2RY11PPAN: 10 106 300–10 112 813, előre szálP2RY11: 10 111 689–10 118 085, előre szálP2RY11EIF3G: 10 115 010–10 119 951, fordított szálEIF3GDNMT1: 10 133 342–10 231 286, fordított szálDNMT1S1PR2: 10 221 433–10 231 331, fordított szálS1PR2MRPL4: 10 251 901–10 260 060, előre szálMRPL4ICAM1: 10 271 120–10 286 615, előre szálICAM1ICAM4: 10 286 946–10 288 522, előre szálICAM4ICAM5: 10 289 940–10 296 778, előre szálICAM5ZGLP1: 10 304 803–10 309 880, fordított szálFDX2-ZGLP1: 10 305 427–10 316 009, fordított szálFDX2: 10 309 898–10 316 026, fordított szál: 10 315 471–10 320 678, fordított szálRAVER1: 10 316 212–10 333 548, fordított szálICAM3: 10 333 776–10 339 847, fordított szálTYK2: 10 350 528–10 380 608, fordított szálTYK2CDC37: 10 391 090–10 420 224, fordított szálCDC37PDE4A: 10 416 773–10 469 816, előre szálPDE4AKEAP1: 10 484 512–10 503 558, fordított szálKEAP1S1PR5: 10 512 742–10 517 981, fordított szálS1PR5ATG4D: 10 543 533–10 553 556, előre szálATG4DKRI1: 10 553 085–10 566 031, fordított szálKRI1CDKN2D: 10 566 460–10 569 059, fordított szálCDKN2DAP1M2: 10 569 431–10 587 317, fordított szálAP1M2SLC44A2: 10 602 457–10 644 559, előre szálSLC44A2ILF3: 10 654 261–10 692 415, előre szálILF3QTRT1: 10 701 430–10 713 747, előre szálQTRT1DNM2: 10 717 967–10 834 209, előre szálDNM2A ICAM1 ábrája: 7 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 10 271 120–10 271 226, 107 bázis2. exon: 10 274 765–10 275 028, 264 bázis3. exon: 10 283 481–10 283 786, 306 bázis4. exon: 10 284 033–10 284 320, 288 bázis5. exon: 10 284 403–10 284 657, 255 bázis6. exon: 10 284 783–10 285 028, 246 bázis7. exon: 10 285 115–10 286 615, 1501 bázis12345675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 15,5 kb-jából 3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1599 bázis kódolja a fehérjét.

ICAM1 szekvenálása

5Könnyű

Mennyire nehéz a ICAM1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A ICAM1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a ICAM1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,9%
  • GC-tartalom24%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ICAM1 gén: intercellular adhesion molecule 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/icam1

Vancouver

Dante Labs. ICAM1 gén: intercellular adhesion molecule 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/icam1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet