Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

HERPUD1

homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
16q13
Koordináták
16. kromoszóma: 56 932 142–56 944 864 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 12,7 kb
Fehérje
391 aminosav
Más néven ismert
KIAA0025, Mif1, HERP, SUP
Korábbi jelölések
HERPUD1-IT1
MANE Select transzkriptum
ENST00000439977.7NM_014685.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) HERPUD1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A HERPUD1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
16. kromoszóma, a HERPUD1 helyét zárójel jelöli. A HERPUD1 és környékén 28 gén a 16. kromoszómán, 56 438 503–57 438 502 között.16. kromoszóma16q13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.356,6 Mb56,8 Mb57 Mb57,2 Mb57,4 MbNUDT21: 56 428 473–56 452 199, fordított szálNUDT21: 56 430 556–56 501 497, fordított szálOGFOD1: 56 451 508–56 479 122, előre szálOGFOD1BBS2: 56 465 640–56 582 667, fordított szálBBS2MT4: 56 565 073–56 569 108, előre szálMT4MT3: 56 589 074–56 591 093, előre szálMT3MT2A: 56 608 130–56 609 503, előre szálMT2AMT1E: 56 625 475–56 627 112, előre szálMT1EMT1M: 56 632 485–56 633 986, előre szálMT1A: 56 638 202–56 640 087, előre szálMT1B: 56 651 885–56 653 204, előre szálMT1F: 56 657 640–56 660 698, előre szálMT1FMT1G: 56 666 730–56 668 072, fordított szálMT1GMT1H: 56 669 660–56 671 135, előre szálMT1HMT1X: 56 682 058–56 686 110, előre szálMT1XNUP93: 56 730 095–56 850 286, előre szálNUP93SLC12A3: 56 865 203–56 915 850, előre szálSLC12A3HERPUD1: 56 932 142–56 944 864, előre szálHERPUD1CETP: 56 961 922–56 983 845, előre szálCETPNLRC5: 56 989 485–57 084 238, előre szálNLRC5CPNE2: 57 092 517–57 148 369, előre szálCPNE2PSME3IP1: 57 152 466–57 186 175, fordított szálPSME3IP1RSPRY1: 57 186 137–57 242 505, előre szálRSPRY1ARL2BP: 57 245 098–57 259 830, előre szálARL2BPPLLP: 57 248 547–57 284 683, fordított szálPLLPCCL22: 57 357 925–57 366 191, előre szálCCL22CX3CL1: 57 372 457–57 385 044, előre szálCX3CL1CCL17: 57 404 767–57 416 063, előre szálCCL17CIAPIN1: 57 428 169–57 447 420, fordított szálCIAPIN1A HERPUD1 ábrája: 8 exon a(z) 16. kromoszóma előre szálán1. exon: 56 932 142–56 932 391, 250 bázis2. exon: 56 935 235–56 935 312, 78 bázis3. exon: 56 935 401–56 935 475, 75 bázis4. exon: 56 936 687–56 936 817, 131 bázis5. exon: 56 939 237–56 939 359, 123 bázis6. exon: 56 939 895–56 940 245, 351 bázis7. exon: 56 942 132–56 942 237, 106 bázis8. exon: 56 943 126–56 944 864, 1739 bázis124685′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 12,7 kb-jából 2,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1176 bázis kódolja a fehérjét.

HERPUD1 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a HERPUD1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A HERPUD1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a HERPUD1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,3%
  • GC-tartalom8,8%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). HERPUD1 gén: homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/herpud1

Vancouver

Dante Labs. HERPUD1 gén: homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/herpud1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet