Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

AIF1L

allograft inflammatory factor 1 like

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9q34.12-q34.13
Koordináták
9. kromoszóma: 131 096 531–131 123 144 (GRCh38)
Exonok
6 exon, összesen 26,6 kb
Fehérje
150 aminosav
Más néven ismert
IBA2, FLJ12783
Korábbi jelölések
C9orf58
MANE Select transzkriptum
ENST00000247291.8NM_031426.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) AIF1L gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A AIF1L felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a AIF1L helyét zárójel jelöli. A AIF1L és környékén 18 gén a 9. kromoszómán, 130 609 838–131 609 837 között.9. kromoszóma9q34.12-q34.13p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3130,8 Mb131 Mb131,2 Mb131,4 Mb131,6 MbFUBP3: 130 578 965–130 638 354, előre szálFUBP3PRDM12: 130 664 594–130 682 986, előre szálPRDM12EXOSC2: 130 693 721–130 707 608, előre szálEXOSC2ABL1: 130 713 043–130 887 675, előre szálABL1: 130 713 626–130 713 724, előre szálQRFP: 130 892 707–130 896 812, fordított szálQRFPFIBCD1: 130 900 194–130 941 232, fordított szálFIBCD1LAMC3: 131 008 878–131 094 473, előre szálLAMC3AIF1L: 131 096 531–131 123 144, előre szálAIF1LNUP214: 131 124 868–131 234 667, előre szálNUP214FAM78A: 131 258 076–131 278 194, fordított szálFAM78APLPP7: 131 289 459–131 359 022, előre szálPLPP7PRRC2B: 131 373 636–131 500 197, előre szálPRRC2B: 131 430 129–131 430 218, előre szál: 131 432 759–131 446 473, előre szálPOMT1: 131 502 789–131 523 806, előre szálPOMT1UCK1: 131 523 756–131 531 289, fordított szálUCK1PRRT1B: 131 545 520–131 560 893, előre szálPRRT1BRAPGEF1: 131 576 758–131 740 134, fordított szálRAPGEF1A AIF1L ábrája: 6 exon a(z) 9. kromoszóma előre szálán1. exon: 131 096 531–131 096 660, 130 bázis2. exon: 131 096 802–131 096 863, 62 bázis3. exon: 131 111 597–131 111 663, 67 bázis4. exon: 131 114 577–131 114 618, 42 bázis5. exon: 131 117 756–131 117 918, 163 bázis6. exon: 131 120 235–131 123 144, 2910 bázis1565′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 26,6 kb-jából 3,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 453 bázis kódolja a fehérjét.

AIF1L szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a AIF1L rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A AIF1L exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a AIF1L exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,1%
  • GC-tartalom5,7%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). AIF1L gén: allograft inflammatory factor 1 like. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/aif1l

Vancouver

Dante Labs. AIF1L gén: allograft inflammatory factor 1 like [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/aif1l

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet