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Gène

SYCP1

synaptonemal complex protein 1

Résumé

Localisation cytogénétique
1p13.2
Coordonnées
Chromosome 1 : 114 854 863–114 995 370 (GRCh38)
Exons
32 exons sur 140,5 kb
Protéine
976 acides aminés
Aussi appelé
HOM-TES-14, SCP1, CT8
Transcrit MANE Select
ENST00000369522.8NM_003176.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SYCP1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SYCP1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de SYCP1. SYCP1 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 114 425 117 à 115 425 116.Chromosome 11p13.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44114,6 Mb114,8 Mb115 Mb115,2 Mb115,4 MbTRIM33 : 114 392 781–114 511 244, brin inverseTRIM33BCAS2 : 114 547 043–114 581 725, brin inverseBCAS2DENND2C : 114 582 848–114 670 451, brin inverseDENND2CAMPD1 : 114 673 090–114 695 620, brin inverseAMPD1NRAS : 114 704 468–114 716 775, brin inverseNRASCSDE1 : 114 716 913–114 758 704, brin inverseCSDE1SIKE1 : 114 769 479–114 780 706, brin inverseSIKE1SYCP1 : 114 854 863–114 995 370, brin directSYCP1TSHB : 115 029 826–115 034 302, brin directTSHBTSPAN2 : 115 047 056–115 089 528, brin inverseTSPAN2NGF : 115 285 904–115 338 770, brin inverseNGFSchéma de SYCP1 : 32 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 114 854 863–114 855 018, 156 basesExon 2 : 114 855 441–114 855 572, 132 basesExon 3 : 114 856 573–114 856 657, 85 basesExon 4 : 114 857 232–114 857 275, 44 basesExon 5 : 114 857 444–114 857 497, 54 basesExon 6 : 114 858 547–114 858 711, 165 basesExon 7 : 114 859 743–114 859 810, 68 basesExon 8 : 114 860 736–114 860 809, 74 basesExon 9 : 114 874 506–114 874 564, 59 basesExon 10 : 114 876 069–114 876 138, 70 basesExon 11 : 114 876 737–114 876 810, 74 basesExon 12 : 114 878 094–114 878 202, 109 basesExon 13 : 114 885 535–114 885 629, 95 basesExon 14 : 114 886 125–114 886 309, 185 basesExon 15 : 114 887 626–114 887 693, 68 basesExon 16 : 114 895 448–114 895 509, 62 basesExon 17 : 114 910 397–114 910 501, 105 basesExon 18 : 114 911 479–114 911 582, 104 basesExon 19 : 114 913 033–114 913 150, 118 basesExon 20 : 114 913 975–114 914 045, 71 basesExon 21 : 114 923 449–114 923 530, 82 basesExon 22 : 114 926 278–114 926 340, 63 basesExon 23 : 114 926 501–114 926 563, 63 basesExon 24 : 114 944 339–114 944 455, 117 basesExon 25 : 114 944 872–114 944 982, 111 basesExon 26 : 114 946 289–114 946 381, 93 basesExon 27 : 114 947 246–114 947 320, 75 basesExon 28 : 114 977 557–114 977 616, 60 basesExon 29 : 114 981 336–114 981 512, 177 basesExon 30 : 114 984 725–114 984 868, 144 basesExon 31 : 114 994 698–114 994 787, 90 basesExon 32 : 114 994 882–114 995 370, 489 bases151015202530325′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,5 kb sur les 140,5 kb du gène ; 2 931 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SYCP1 : synaptonemal complex protein 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sycp1

Vancouver

Dante Labs. Gène SYCP1 : synaptonemal complex protein 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sycp1

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