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Gène

CSDE1

cold shock domain containing E1

Résumé

Localisation cytogénétique
1p13.2
Coordonnées
Chromosome 1 : 114 716 916–114 757 984 (GRCh38)
Exons
20 exons sur 41,1 kb
Protéine
798 acides aminés
Aussi appelé
D1S155E, UNR
Transcrit MANE Select
ENST00000358528.9NM_001007553.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CSDE1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CSDE1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de CSDE1. CSDE1 et 9 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 114 237 450 à 115 237 449.Chromosome 11p13.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44114,4 Mb114,6 Mb114,8 Mb115 Mb115,2 MbTRIM33 : 114 392 781–114 511 244, brin inverseTRIM33BCAS2 : 114 547 043–114 581 725, brin inverseBCAS2DENND2C : 114 582 848–114 670 451, brin inverseDENND2CAMPD1 : 114 673 090–114 695 620, brin inverseAMPD1NRAS : 114 704 468–114 716 775, brin inverseNRASCSDE1 : 114 716 916–114 757 984, brin inverseCSDE1SIKE1 : 114 769 479–114 780 706, brin inverseSIKE1SYCP1 : 114 854 836–114 995 370, brin directSYCP1TSHB : 115 029 826–115 034 302, brin directTSHBTSPAN2 : 115 047 056–115 089 528, brin inverseTSPAN2Schéma de CSDE1 : 20 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 20 : 114 716 916–114 718 216, 1 301 basesExon 19 : 114 718 613–114 718 745, 133 basesExon 18 : 114 719 579–114 719 742, 164 basesExon 17 : 114 720 539–114 720 717, 179 basesExon 16 : 114 723 883–114 724 002, 120 basesExon 15 : 114 725 221–114 725 333, 113 basesExon 14 : 114 726 211–114 726 386, 176 basesExon 13 : 114 726 983–114 727 090, 108 basesExon 12 : 114 730 258–114 730 422, 165 basesExon 11 : 114 730 508–114 730 648, 141 basesExon 10 : 114 732 604–114 732 816, 213 basesExon 9 : 114 733 732–114 733 857, 126 basesExon 8 : 114 733 989–114 734 117, 129 basesExon 7 : 114 734 442–114 734 523, 82 basesExon 6 : 114 736 758–114 736 855, 98 basesExon 5 : 114 737 471–114 737 563, 93 basesExon 4 : 114 737 963–114 738 072, 110 basesExon 3 : 114 739 692–114 739 890, 199 basesExon 2 : 114 749 821–114 750 207, 387 basesExon 1 : 114 757 925–114 757 984, 60 bases201816141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,1 kb sur les 41,1 kb du gène ; 2 397 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène CSDE1 : cold shock domain containing E1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/csde1

Vancouver

Dante Labs. Gène CSDE1 : cold shock domain containing E1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/csde1

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