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Gène

SMPD2

sphingomyelin phosphodiesterase 2

Résumé

Localisation cytogénétique
6q21
Coordonnées
Chromosome 6 : 109 440 724–109 443 919 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 3,2 kb
Protéine
423 acides aminés
Aussi appelé
nSMase, ISC1
Transcrit MANE Select
ENST00000258052.8NM_003080.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SMPD2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SMPD2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de SMPD2. SMPD2 et 9 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 108 942 322 à 109 942 321.Chromosome 66q21p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27109 Mb109,2 Mb109,4 Mb109,6 Mb109,8 MbARMC2 : 108 841 937–108 974 551, brin directARMC2SESN1 : 108 984 309–109 095 097, brin inverseSESN1CEP57L1 : 109 095 105–109 174 418, brin directCEP57L1CD164 : 109 307 627–109 382 536, brin inverseCD164PPIL6 : 109 390 215–109 441 171, brin inversePPIL6SMPD2 : 109 440 724–109 443 919, brin directSMPD2MICAL1 : 109 444 062–109 465 968, brin inverseMICAL1ZBTB24 : 109 460 632–109 483 273, brin inverseZBTB24AK9 : 109 492 855–109 691 229, brin inverseAK9FIG4 : 109 690 609–109 878 098, brin directFIG4Schéma de SMPD2 : 10 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 1 : 109 440 724–109 441 171, 448 basesExon 2 : 109 441 357–109 441 453, 97 basesExon 3 : 109 441 552–109 441 628, 77 basesExon 4 : 109 441 974–109 442 067, 94 basesExon 5 : 109 442 210–109 442 299, 90 basesExon 6 : 109 442 543–109 442 625, 83 basesExon 7 : 109 442 752–109 442 884, 133 basesExon 8 : 109 442 977–109 443 081, 105 basesExon 9 : 109 443 267–109 443 420, 154 basesExon 10 : 109 443 517–109 443 919, 403 bases123456789105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,7 kb sur les 3,2 kb du gène ; 1 272 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SMPD2 : sphingomyelin phosphodiesterase 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/smpd2

Vancouver

Dante Labs. Gène SMPD2 : sphingomyelin phosphodiesterase 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/smpd2

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