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Gène

SMG1

SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase

Résumé

Localisation cytogénétique
16p12.3
Coordonnées
Chromosome 16 : 18 804 860–18 926 408 (GRCh38)
Exons
63 exons sur 121,5 kb
Protéine
3 661 acides aminés
Aussi appelé
LIP, KIAA0421, ATX
Transcrit MANE Select
ENST00000446231.7NM_015092.5
Type de locus
Protein-coding

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SMG1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SMG1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de SMG1. SMG1 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 18 365 634 à 19 365 633.Chromosome 1616p12.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.318,4 Mb18,6 Mb18,8 Mb19 Mb19,2 MbNPIPA9 : 18 358 086–18 379 331, brin inverseNPIPA9NOMO2 : 18 417 325–18 562 211, brin inverseNOMO2RPS15A : 18 775 365–18 790 420, brin inverseRPS15A : 18 788 063–18 801 519, brin inverseARL6IP1 : 18 791 609–18 801 572, brin inverseARL6IP1SMG1 : 18 804 860–18 926 408, brin inverseSMG1TMC7 : 18 983 928–19 063 947, brin directTMC7COQ7 : 19 067 564–19 082 190, brin directCOQ7ITPRIPL2 : 19 113 932–19 121 629, brin directITPRIPL2SYT17 : 19 167 971–19 268 334, brin directSYT17CLEC19A : 19 285 731–19 322 145, brin directCLEC19ASchéma de SMG1 : 63 exons sur le brin inverse du chromosome 16Exon 63 : 18 804 860–18 809 646, 4 787 basesExon 62 : 18 811 761–18 811 867, 107 basesExon 61 : 18 811 948–18 812 127, 180 basesExon 60 : 18 815 175–18 815 281, 107 basesExon 59 : 18 815 440–18 815 651, 212 basesExon 58 : 18 816 302–18 816 529, 228 basesExon 57 : 18 817 291–18 817 470, 180 basesExon 56 : 18 819 502–18 819 654, 153 basesExon 55 : 18 828 031–18 828 168, 138 basesExon 54 : 18 829 286–18 829 755, 470 basesExon 53 : 18 829 926–18 830 115, 190 basesExon 52 : 18 830 219–18 830 369, 151 basesExon 51 : 18 832 940–18 833 166, 227 basesExon 50 : 18 834 204–18 834 438, 235 basesExon 49 : 18 834 892–18 835 164, 273 basesExon 48 : 18 835 933–18 836 212, 280 basesExon 47 : 18 836 360–18 836 532, 173 basesExon 46 : 18 837 253–18 837 443, 191 basesExon 45 : 18 838 014–18 838 232, 219 basesExon 44 : 18 838 357–18 838 466, 110 basesExon 43 : 18 838 551–18 838 689, 139 basesExon 42 : 18 839 698–18 839 946, 249 basesExon 41 : 18 841 565–18 841 794, 230 basesExon 40 : 18 842 208–18 842 454, 247 basesExon 39 : 18 845 429–18 845 651, 223 basesExon 38 : 18 847 453–18 847 607, 155 basesExon 37 : 18 847 816–18 848 033, 218 basesExon 36 : 18 849 217–18 849 378, 162 basesExon 35 : 18 849 949–18 850 126, 178 basesExon 34 : 18 850 237–18 850 467, 231 basesExon 33 : 18 852 067–18 852 205, 139 basesExon 32 : 18 852 318–18 852 462, 145 basesExon 31 : 18 853 583–18 853 867, 285 basesExon 30 : 18 854 656–18 854 904, 249 basesExon 29 : 18 858 170–18 858 290, 121 basesExon 28 : 18 859 022–18 859 181, 160 basesExon 27 : 18 859 556–18 859 703, 148 basesExon 26 : 18 860 667–18 860 776, 110 basesExon 25 : 18 863 650–18 863 851, 202 basesExon 24 : 18 864 002–18 864 144, 143 basesExon 23 : 18 866 621–18 866 775, 155 basesExon 22 : 18 868 190–18 868 354, 165 basesExon 21 : 18 868 523–18 868 719, 197 basesExon 20 : 18 869 104–18 869 303, 200 basesExon 19 : 18 869 854–18 869 994, 141 basesExon 18 : 18 870 610–18 870 711, 102 basesExon 17 : 18 870 801–18 870 888, 88 basesExon 16 : 18 871 364–18 871 482, 119 basesExon 15 : 18 872 184–18 872 345, 162 basesExon 14 : 18 872 494–18 872 624, 131 basesExon 13 : 18 876 124–18 876 393, 270 basesExon 12 : 18 877 131–18 877 232, 102 basesExon 11 : 18 879 495–18 879 719, 225 basesExon 10 : 18 882 165–18 882 338, 174 basesExon 9 : 18 884 070–18 884 167, 98 basesExon 8 : 18 885 090–18 885 162, 73 basesExon 7 : 18 885 541–18 885 666, 126 basesExon 6 : 18 889 372–18 889 585, 214 basesExon 5 : 18 890 863–18 890 921, 59 basesExon 4 : 18 892 218–18 892 354, 137 basesExon 3 : 18 896 052–18 896 207, 156 basesExon 2 : 18 896 793–18 896 956, 164 basesExon 1 : 18 925 950–18 926 408, 459 bases636055504540353025201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 16,1 kb sur les 121,5 kb du gène ; 10 986 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SMG1 : SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/smg1

Vancouver

Dante Labs. Gène SMG1 : SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/smg1

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