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Gen

SMG1

SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
16p12.3
Koordinaten
Chromosom 16: 18.804.860–18.926.408 (GRCh38)
Exons
63 Exons über 121,5 kb
Protein
3.661 Aminosäuren
Auch bekannt als
LIP, KIAA0421, ATX
MANE-Select-Transkript
ENST00000446231.7NM_015092.5
Locus-Typ
gene with protein product

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SMG1 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SMG1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 16, mit einer Klammer, an der SMG1 liegt. SMG1 und 10 Gene in der Nähe auf Chromosom 16, von 18.365.634 bis 19.365.633.Chromosom 1616p12.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.318,4 Mb18,6 Mb18,8 Mb19 Mb19,2 MbNPIPA9: 18.358.086–18.379.331, Minus-StrangNPIPA9NOMO2: 18.417.325–18.562.211, Minus-StrangNOMO2RPS15A: 18.775.365–18.790.420, Minus-StrangRPS15A: 18.788.063–18.801.519, Minus-StrangARL6IP1: 18.791.609–18.801.572, Minus-StrangARL6IP1SMG1: 18.804.860–18.926.408, Minus-StrangSMG1TMC7: 18.983.928–19.063.947, Plus-StrangTMC7COQ7: 19.067.564–19.082.190, Plus-StrangCOQ7ITPRIPL2: 19.113.932–19.121.629, Plus-StrangITPRIPL2SYT17: 19.167.971–19.268.334, Plus-StrangSYT17CLEC19A: 19.285.731–19.322.145, Plus-StrangCLEC19ADiagramm von SMG1: 63 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 16Exon 63: 18.804.860–18.809.646, 4.787 BasenExon 62: 18.811.761–18.811.867, 107 BasenExon 61: 18.811.948–18.812.127, 180 BasenExon 60: 18.815.175–18.815.281, 107 BasenExon 59: 18.815.440–18.815.651, 212 BasenExon 58: 18.816.302–18.816.529, 228 BasenExon 57: 18.817.291–18.817.470, 180 BasenExon 56: 18.819.502–18.819.654, 153 BasenExon 55: 18.828.031–18.828.168, 138 BasenExon 54: 18.829.286–18.829.755, 470 BasenExon 53: 18.829.926–18.830.115, 190 BasenExon 52: 18.830.219–18.830.369, 151 BasenExon 51: 18.832.940–18.833.166, 227 BasenExon 50: 18.834.204–18.834.438, 235 BasenExon 49: 18.834.892–18.835.164, 273 BasenExon 48: 18.835.933–18.836.212, 280 BasenExon 47: 18.836.360–18.836.532, 173 BasenExon 46: 18.837.253–18.837.443, 191 BasenExon 45: 18.838.014–18.838.232, 219 BasenExon 44: 18.838.357–18.838.466, 110 BasenExon 43: 18.838.551–18.838.689, 139 BasenExon 42: 18.839.698–18.839.946, 249 BasenExon 41: 18.841.565–18.841.794, 230 BasenExon 40: 18.842.208–18.842.454, 247 BasenExon 39: 18.845.429–18.845.651, 223 BasenExon 38: 18.847.453–18.847.607, 155 BasenExon 37: 18.847.816–18.848.033, 218 BasenExon 36: 18.849.217–18.849.378, 162 BasenExon 35: 18.849.949–18.850.126, 178 BasenExon 34: 18.850.237–18.850.467, 231 BasenExon 33: 18.852.067–18.852.205, 139 BasenExon 32: 18.852.318–18.852.462, 145 BasenExon 31: 18.853.583–18.853.867, 285 BasenExon 30: 18.854.656–18.854.904, 249 BasenExon 29: 18.858.170–18.858.290, 121 BasenExon 28: 18.859.022–18.859.181, 160 BasenExon 27: 18.859.556–18.859.703, 148 BasenExon 26: 18.860.667–18.860.776, 110 BasenExon 25: 18.863.650–18.863.851, 202 BasenExon 24: 18.864.002–18.864.144, 143 BasenExon 23: 18.866.621–18.866.775, 155 BasenExon 22: 18.868.190–18.868.354, 165 BasenExon 21: 18.868.523–18.868.719, 197 BasenExon 20: 18.869.104–18.869.303, 200 BasenExon 19: 18.869.854–18.869.994, 141 BasenExon 18: 18.870.610–18.870.711, 102 BasenExon 17: 18.870.801–18.870.888, 88 BasenExon 16: 18.871.364–18.871.482, 119 BasenExon 15: 18.872.184–18.872.345, 162 BasenExon 14: 18.872.494–18.872.624, 131 BasenExon 13: 18.876.124–18.876.393, 270 BasenExon 12: 18.877.131–18.877.232, 102 BasenExon 11: 18.879.495–18.879.719, 225 BasenExon 10: 18.882.165–18.882.338, 174 BasenExon 9: 18.884.070–18.884.167, 98 BasenExon 8: 18.885.090–18.885.162, 73 BasenExon 7: 18.885.541–18.885.666, 126 BasenExon 6: 18.889.372–18.889.585, 214 BasenExon 5: 18.890.863–18.890.921, 59 BasenExon 4: 18.892.218–18.892.354, 137 BasenExon 3: 18.896.052–18.896.207, 156 BasenExon 2: 18.896.793–18.896.956, 164 BasenExon 1: 18.925.950–18.926.408, 459 Basen636055504540353025201510515′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 16,1 kb der 121,5 kb des Gens aus; 10.986 dieser Basen kodieren für das Protein.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). SMG1-Gen: SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/smg1

Vancouver

Dante Labs. SMG1-Gen: SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/smg1

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