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Gène

SLCO4A1

solute carrier organic anion transporter family member 4A1

Résumé

Localisation cytogénétique
20q13.33
Coordonnées
Chromosome 20 : 62 642 503–62 672 293 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 29,8 kb
Protéine
722 acides aminés
Aussi appelé
OATP-E, OATP4A1
Symboles précédents
SLC21A12
Transcrit MANE Select
ENST00000217159.6NM_016354.4
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SLCO4A1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SLCO4A1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de SLCO4A1. SLCO4A1 et 19 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 62 157 398 à 63 157 397.Chromosome 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3362,2 Mb62,4 Mb62,6 Mb62,8 Mb63 MbSS18L1 : 62 143 606–62 182 514, brin directSS18L1MTG2 : 62 183 005–62 203 571, brin directMTG2HRH3 : 62 214 960–62 220 303, brin inverseHRH3OSBPL2 : 62 231 922–62 296 213, brin directOSBPL2ADRM1 : 62 302 046–62 308 867, brin directADRM1LAMA5 : 62 307 955–62 367 333, brin inverseLAMA5RPS21 : 62 365 598–62 388 680, brin directRPS21CABLES2 : 62 388 630–62 407 319, brin inverseCABLES2RBBP8NL : 62 410 143–62 427 548, brin inverseRBBP8NLGATA5 : 62 463 481–62 476 094, brin inverseGATA5SLCO4A1 : 62 642 503–62 672 293, brin directSLCO4A1NTSR1 : 62 708 427–62 762 771, brin directNTSR1MRGBP : 62 796 452–62 801 729, brin directMRGBPOGFR : 62 804 178–62 814 000, brin directOGFRCOL9A3 : 62 816 244–62 841 164, brin directCOL9A3TCFL5 : 62 840 997–62 861 840, brin inverseTCFL5DIDO1 : 62 877 738–62 937 992, brin inverseDIDO1GID8 : 62 937 060–62 948 589, brin directGID8SLC17A9 : 62 952 645–62 969 588, brin directSLC17A9BHLHE23 : 63 005 927–63 007 035, brin inverseBHLHE23Schéma de SLCO4A1 : 12 exons sur le brin direct du chromosome 20Exon 1 : 62 642 503–62 642 553, 51 basesExon 2 : 62 656 359–62 657 250, 892 basesExon 3 : 62 658 677–62 658 767, 91 basesExon 4 : 62 660 412–62 660 533, 122 basesExon 5 : 62 661 064–62 661 175, 112 basesExon 6 : 62 664 934–62 665 088, 155 basesExon 7 : 62 666 380–62 666 575, 196 basesExon 8 : 62 667 745–62 667 910, 166 basesExon 9 : 62 668 012–62 668 184, 173 basesExon 10 : 62 668 477–62 668 541, 65 basesExon 11 : 62 668 930–62 669 078, 149 basesExon 12 : 62 671 750–62 672 293, 544 bases1246810125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,7 kb sur les 29,8 kb du gène ; 2 169 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLCO4A1 : solute carrier organic anion transporter family member 4A1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slco4a1

Vancouver

Dante Labs. Gène SLCO4A1 : solute carrier organic anion transporter family member 4A1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slco4a1

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