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Gène

HOXC5

homeobox C5

Résumé

Localisation cytogénétique
12q13.13
Coordonnées
Chromosome 12 : 54 033 050–54 035 361 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 2,3 kb
Protéine
222 acides aminés
Symboles précédents
HOX3D, HOX3
Transcrit MANE Select
ENST00000312492.3NM_018953.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HOXC5. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HOXC5

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de HOXC5. HOXC5 et 23 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 53 534 206 à 54 534 205.Chromosome 1212q13.13p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3353,6 Mb53,8 Mb54 Mb54,2 Mb54,4 MbATF7-NPFF : 53 506 691–53 625 979, brin inverseATF7-NPFFATF7 : 53 507 856–53 626 412, brin inverseATF7ATP5MC2 : 53 626 515–53 678 658, brin inverseATP5MC2CALCOCO1 : 53 708 517–53 727 745, brin inverseCALCOCO1HOXC13 : 53 938 718–53 946 544, brin directHOXC13HOXC12 : 53 954 903–53 958 956, brin directHOXC11 : 53 973 126–53 977 643, brin directHOXC10 : 53 985 065–53 990 279, brin direct : 53 985 845–54 034 888, brin directHOXC6 : 53 990 624–54 030 823, brin directHOXC6HOXC9 : 53 994 895–54 003 337, brin directHOXC8 : 54 008 911–54 012 769, brin directHOXC8HOXC4 : 54 015 897–54 056 030, brin directHOXC4HOXC5 : 54 033 050–54 035 361, brin directHOXC5SMUG1 : 54 121 277–54 189 008, brin inverseSMUG1CBX5 : 54 230 942–54 280 141, brin inverseCBX5HNRNPA1 : 54 280 193–54 287 088, brin directHNRNPA1NFE2 : 54 292 107–54 301 259, brin inverseNFE2COPZ1 : 54 301 202–54 351 848, brin directCOPZ1GPR84 : 54 362 445–54 364 493, brin inverseGPR84ZNF385A : 54 369 129–54 391 338, brin inverseZNF385AITGA5 : 54 395 261–54 419 515, brin inverseITGA5GTSF1 : 54 455 950–54 473 602, brin inverseGTSF1NCKAP1L : 54 497 713–54 548 243, brin directNCKAP1LSchéma de HOXC5 : 2 exons sur le brin direct du chromosome 12Exon 1 : 54 033 050–54 033 576, 527 basesExon 2 : 54 034 278–54 035 361, 1 084 bases125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 2,3 kb du gène ; 669 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène HOXC5 : homeobox C5. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hoxc5

Vancouver

Dante Labs. Gène HOXC5 : homeobox C5 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hoxc5

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