Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

HOXC5

homeobox C5

Samenvatting

Cytogenetische locatie
12q13.13
Coördinaten
Chromosoom 12: 54.033.050–54.035.361 (GRCh38)
Exons
2 exons over 2,3 kb
Eiwit
222 aminozuren
Eerdere symbolen
HOX3D, HOX3
MANE Select-transcript
ENST00000312492.3NM_018953.4
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest HOXC5 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van HOXC5

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
Chromosoom 12, met een haakje waar HOXC5 zich bevindt. HOXC5 en 23 genen in de buurt op chromosoom 12, van 53.534.206 tot 54.534.205.Chromosoom 1212q13.13p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3353,6 Mb53,8 Mb54 Mb54,2 Mb54,4 MbATF7-NPFF: 53.506.691–53.625.979, omgekeerde-strengATF7-NPFFATF7: 53.507.856–53.626.412, omgekeerde-strengATF7ATP5MC2: 53.626.515–53.678.658, omgekeerde-strengATP5MC2CALCOCO1: 53.708.517–53.727.745, omgekeerde-strengCALCOCO1HOXC13: 53.938.718–53.946.544, voorwaartse-strengHOXC13HOXC12: 53.954.903–53.958.956, voorwaartse-strengHOXC11: 53.973.126–53.977.643, voorwaartse-strengHOXC10: 53.985.065–53.990.279, voorwaartse-streng: 53.985.845–54.034.888, voorwaartse-strengHOXC6: 53.990.624–54.030.823, voorwaartse-strengHOXC6HOXC9: 53.994.895–54.003.337, voorwaartse-strengHOXC8: 54.008.911–54.012.769, voorwaartse-strengHOXC8HOXC4: 54.015.897–54.056.030, voorwaartse-strengHOXC4HOXC5: 54.033.050–54.035.361, voorwaartse-strengHOXC5SMUG1: 54.121.277–54.189.008, omgekeerde-strengSMUG1CBX5: 54.230.942–54.280.141, omgekeerde-strengCBX5HNRNPA1: 54.280.193–54.287.088, voorwaartse-strengHNRNPA1NFE2: 54.292.107–54.301.259, omgekeerde-strengNFE2COPZ1: 54.301.202–54.351.848, voorwaartse-strengCOPZ1GPR84: 54.362.445–54.364.493, omgekeerde-strengGPR84ZNF385A: 54.369.129–54.391.338, omgekeerde-strengZNF385AITGA5: 54.395.261–54.419.515, omgekeerde-strengITGA5GTSF1: 54.455.950–54.473.602, omgekeerde-strengGTSF1NCKAP1L: 54.497.713–54.548.243, voorwaartse-strengNCKAP1LDiagram van HOXC5: 2 exons op de voorwaartse streng van chromosoom 12Exon 1: 54.033.050–54.033.576, 527 basenExon 2: 54.034.278–54.035.361, 1.084 basen125′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 1,6 kb van de 2,3 kb van het gen; 669 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing van HOXC5

5Laag

Hoe moeilijk HOXC5 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100

  • Mappability0%
  • Homologie0%
  • Herhalingen1,1%
  • GC-gehalte45%
  • Referentiedekking0%

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). HOXC5-gen: homeobox C5. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/hoxc5

Vancouver

Dante Labs. HOXC5-gen: homeobox C5 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/hoxc5

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen