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Gène

FOXD3

forkhead box D3

Résumé

Localisation cytogénétique
1p31.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 63 322 567–63 325 128 (GRCh38)
Exons
1 exon sur 2,6 kb
Protéine
478 acides aminés
Aussi appelé
Genesis, HFH2
Transcrit MANE Select
ENST00000371116.4NM_012183.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore FOXD3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de FOXD3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de FOXD3. FOXD3 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 62 823 848 à 63 823 847.Chromosome 11p31.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4463 Mb63,2 Mb63,4 Mb63,6 Mb63,8 MbATG4C : 62 783 821–62 866 217, brin directATG4CITGB3BP : 63 320 884–63 593 721, brin inverseITGB3BPALG6 : 63 321 730–63 440 448, brin directALG6FOXD3 : 63 322 567–63 325 128, brin directFOXD3EFCAB7 : 63 523 317–63 572 693, brin directEFCAB7PGM1 : 63 593 151–63 660 245, brin directPGM1ROR1 : 63 773 987–64 181 625, brin directROR1Schéma de FOXD3 : un exon sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 63 322 567–63 325 128, 2 562 bases15′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,6 kb sur les 2,6 kb du gène ; 1 437 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de FOXD3

10Modérée

Difficulté de séquençage de FOXD3 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité1,2 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions6,8 %
  • Teneur en GC90 %
  • Couverture de référence0 %

Traits associés à FOXD3

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que FOXD3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène FOXD3 : forkhead box D3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/foxd3

Vancouver

Dante Labs. Gène FOXD3 : forkhead box D3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/foxd3

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