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Gène

FBXL20

F-box and leucine rich repeat protein 20

Résumé

Localisation cytogénétique
17q12
Coordonnées
Chromosome 17 : 39 252 663–39 401 626 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 149 kb
Protéine
436 acides aminés
Aussi appelé
MGC15482, Fbl2, Fbl20
Transcrit MANE Select
ENST00000264658.11NM_032875.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore FBXL20. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de FBXL20

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de FBXL20. FBXL20 et 22 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 38 827 145 à 39 827 144.Chromosome 1717q12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.339 Mb39,2 Mb39,4 Mb39,6 Mb39,8 MbSPMAP1 : 38 835 086–38 841 438, brin inverseSPMAP1RPL23 : 38 847 860–38 868 644, brin inverseRPL23LASP1 : 38 869 185–38 921 771, brin directLASP1LASP1NB : 38 925 565–38 929 381, brin directLASP1NBFBXO47 : 38 936 432–38 967 407, brin inverseFBXO47PLXDC1 : 39 063 313–39 154 394, brin inversePLXDC1ARL5C : 39 156 894–39 167 484, brin inverseARL5CCACNB1 : 39 173 453–39 197 877, brin inverseCACNB1RPL19 : 39 200 282–39 204 840, brin directRPL19STAC2 : 39 210 540–39 225 945, brin inverseSTAC2FBXL20 : 39 252 663–39 401 626, brin inverseFBXL20MED1 : 39 404 253–39 451 306, brin inverseMED1CDK12 : 39 461 437–39 567 559, brin directCDK12NEUROD2 : 39 603 536–39 609 777, brin inverseNEUROD2PPP1R1B : 39 626 740–39 636 626, brin directPPP1R1BSTARD3 : 39 637 058–39 664 201, brin directSTARD3TCAP : 39 664 990–39 666 554, brin directTCAPPNMT : 39 667 981–39 670 484, brin directPNMTPGAP3 : 39 671 120–39 696 797, brin inverseERBB2 : 39 687 914–39 730 426, brin directERBB2MIEN1 : 39 728 496–39 730 555, brin inverseMIEN1GRB7 : 39 737 490–39 747 292, brin directGRB7IKZF3 : 39 757 715–39 864 368, brin inverseIKZF3Schéma de FBXL20 : 15 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 15 : 39 252 663–39 261 567, 8 905 basesExon 14 : 39 264 175–39 264 387, 213 basesExon 13 : 39 265 397–39 265 453, 57 basesExon 12 : 39 268 827–39 268 871, 45 basesExon 11 : 39 270 796–39 270 856, 61 basesExon 10 : 39 274 970–39 275 100, 131 basesExon 9 : 39 281 389–39 281 463, 75 basesExon 8 : 39 282 729–39 282 855, 127 basesExon 7 : 39 285 478–39 285 573, 96 basesExon 6 : 39 297 127–39 297 195, 69 basesExon 5 : 39 298 990–39 299 084, 95 basesExon 4 : 39 301 001–39 301 075, 75 basesExon 3 : 39 303 585–39 303 639, 55 basesExon 2 : 39 343 180–39 343 241, 62 basesExon 1 : 39 401 361–39 401 626, 266 bases15141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 10,3 kb sur les 149 kb du gène ; 1 311 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de FBXL20

2Faible

Difficulté de séquençage de FBXL20 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité2,3 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions4,8 %
  • Teneur en GC4,4 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène FBXL20 : F-box and leucine rich repeat protein 20. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/fbxl20

Vancouver

Dante Labs. Gène FBXL20 : F-box and leucine rich repeat protein 20 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/fbxl20

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