Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

ZSWIM4

zinc finger SWIM-type containing 4

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
19p13.13
Koordinaatit
Kromosomi 19: 13 795 443–13 832 254 (GRCh38)
Eksonit
14 eksonia 36,8 kb:n alueella
Proteiini
1 106 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FLJ12221
MANE Select -transkripti
ENST00000590508.6NM_001367834.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä ZSWIM4. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

ZSWIM4-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 19, jossa hakasulke osoittaa ZSWIM4-geenin sijainnin. ZSWIM4 ja 20 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 19, välillä 13 313 849–14 313 848.Kromosomi 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4313,4 Mb13,6 Mb13,8 Mb14 Mb14,2 MbCACNA1A: 13 206 442–13 624 489, juoste taaksepäinCACNA1AYJU2B: 13 731 746–13 763 298, juoste eteenpäinYJU2BMRI1: 13 764 498–13 774 282, juoste eteenpäinMRI1C19orf53: 13 774 439–13 778 773, juoste eteenpäinC19orf53ZSWIM4: 13 795 443–13 832 254, juoste eteenpäinZSWIM4NANOS3: 13 862 063–13 880 757, juoste eteenpäinNANOS3BRME1: 13 882 343–13 906 572, juoste taaksepäinBRME1CC2D1A: 13 906 160–13 930 884, juoste eteenpäinCC2D1APODNL1: 13 931 183–13 953 392, juoste taaksepäinPODNL1DCAF15: 13 952 459–13 961 449, juoste eteenpäinDCAF15RFX1: 13 961 529–14 007 084, juoste taaksepäinRFX1RLN3: 14 028 148–14 031 552, juoste eteenpäinRLN3IL27RA: 14 031 644–14 053 223, juoste eteenpäinIL27RAPALM3: 14 053 363–14 062 149, juoste taaksepäinPALM3MISP3: 14 072 108–14 075 062, juoste eteenpäinMISP3C19orf67: 14 081 624–14 085 875, juoste taaksepäinSAMD1: 14 086 762–14 091 036, juoste taaksepäinPRKACA: 14 091 688–14 118 084, juoste taaksepäinPRKACASMIM46: 14 112 324–14 112 476, juoste taaksepäinASF1B: 14 119 512–14 136 622, juoste taaksepäinASF1BADGRL1: 14 147 743–14 206 852, juoste taaksepäinADGRL1ZSWIM4-kaavio: 14 eksonia kromosomin 19 juosteella, eteenpäinEkson 1: 13 795 443–13 795 801, 359 emästäEkson 2: 13 799 720–13 799 921, 202 emästäEkson 3: 13 804 792–13 805 148, 357 emästäEkson 4: 13 808 836–13 808 984, 149 emästäEkson 5: 13 809 070–13 809 220, 151 emästäEkson 6: 13 812 997–13 813 164, 168 emästäEkson 7: 13 814 515–13 814 865, 351 emästäEkson 8: 13 817 216–13 817 353, 138 emästäEkson 9: 13 817 722–13 817 976, 255 emästäEkson 10: 13 819 357–13 819 492, 136 emästäEkson 11: 13 823 346–13 823 500, 155 emästäEkson 12: 13 825 550–13 825 713, 164 emästäEkson 13: 13 828 645–13 828 726, 82 emästäEkson 14: 13 830 191–13 832 254, 2 064 emästä124681012145′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,7 kb geenin 36,8 kb:stä; 3 321 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

ZSWIM4-geenin sekvensointi

11Helppo

Kuinka vaikea ZSWIM4-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki ZSWIM4-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa ZSWIM4-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot9 %
  • GC-pitoisuus42 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). ZSWIM4-geeni: zinc finger SWIM-type containing 4. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/zswim4

Vancouver

Dante Labs. ZSWIM4-geeni: zinc finger SWIM-type containing 4 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/zswim4

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test