Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

TPTE

transmembrane phosphatase with tensin homology

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
21p11.2
Koordinaatit
Kromosomi 21: 10 521 583–10 605 716 (GRCh38)
Eksonit
24 eksonia 84,1 kb:n alueella
Proteiini
551 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
PTEN2, CT44, TPTE1
MANE Select -transkripti
ENST00000618007.5NM_199261.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä TPTE. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

TPTE-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 21, jossa hakasulke osoittaa TPTE-geenin sijainnin. TPTE ja 0 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 21, välillä 10 063 650–11 063 649.Kromosomi 2121p11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.310,2 Mb10,4 Mb10,6 Mb10,8 Mb11 MbTPTE: 10 521 583–10 605 716, juoste eteenpäinTPTETPTE-kaavio: 24 eksonia kromosomin 21 juosteella, eteenpäinEkson 1: 10 521 583–10 521 694, 112 emästäEkson 2: 10 524 580–10 524 688, 109 emästäEkson 3: 10 527 355–10 527 412, 58 emästäEkson 4: 10 538 681–10 538 734, 54 emästäEkson 5: 10 541 112–10 541 165, 54 emästäEkson 6: 10 542 395–10 542 448, 54 emästäEkson 7: 10 543 329–10 543 382, 54 emästäEkson 8: 10 552 657–10 552 716, 60 emästäEkson 9: 10 559 494–10 559 544, 51 emästäEkson 10: 10 561 030–10 561 191, 162 emästäEkson 11: 10 567 670–10 567 789, 120 emästäEkson 12: 10 569 437–10 569 536, 100 emästäEkson 13: 10 569 683–10 569 746, 64 emästäEkson 14: 10 570 485–10 570 549, 65 emästäEkson 15: 10 577 460–10 577 520, 61 emästäEkson 16: 10 578 337–10 578 418, 82 emästäEkson 17: 10 578 517–10 578 605, 89 emästäEkson 18: 10 590 462–10 590 523, 62 emästäEkson 19: 10 592 293–10 592 373, 81 emästäEkson 20: 10 595 982–10 596 087, 106 emästäEkson 21: 10 598 015–10 598 094, 80 emästäEkson 22: 10 602 058–10 602 150, 93 emästäEkson 23: 10 603 562–10 603 632, 71 emästäEkson 24: 10 605 417–10 605 716, 300 emästä15101520245′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,1 kb geenin 84,1 kb:stä; 1 656 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

TPTE-geenin sekvensointi

70Vaikea

Kuinka vaikea TPTE-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Suuri osa TPTE-geenistä sijaitsee kohdissa, joissa lyhyet lukemat voivat jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa TPTE-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus23 %
  • Homologia100 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot4,4 %
  • GC-pitoisuus12 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). TPTE-geeni: transmembrane phosphatase with tensin homology. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tpte

Vancouver

Dante Labs. TPTE-geeni: transmembrane phosphatase with tensin homology [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tpte

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test