Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

TPTE

transmembrane phosphatase with tensin homology

Sammanfattning

Cytogenetisk position
21p11.2
Koordinater
Kromosom 21: 10 521 583–10 605 716 (GRCh38)
Exoner
24 exoner på 84,1 kb
Protein
551 aminosyror
Även känd som
PTEN2, CT44, TPTE1
MANE Select-transkript
ENST00000618007.5NM_199261.4
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser TPTE ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är TPTE uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 21, med en parentes där TPTE finns. TPTE och 0 gener i närheten på kromosom 21, från 10 063 650 till 11 063 649.Kromosom 2121p11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.310,2 Mb10,4 Mb10,6 Mb10,8 Mb11 MbTPTE: 10 521 583–10 605 716, framåt-strängTPTEDiagram över TPTE: 24 exoner på framåt-strängen av kromosom 21Exon 1: 10 521 583–10 521 694, 112 baserExon 2: 10 524 580–10 524 688, 109 baserExon 3: 10 527 355–10 527 412, 58 baserExon 4: 10 538 681–10 538 734, 54 baserExon 5: 10 541 112–10 541 165, 54 baserExon 6: 10 542 395–10 542 448, 54 baserExon 7: 10 543 329–10 543 382, 54 baserExon 8: 10 552 657–10 552 716, 60 baserExon 9: 10 559 494–10 559 544, 51 baserExon 10: 10 561 030–10 561 191, 162 baserExon 11: 10 567 670–10 567 789, 120 baserExon 12: 10 569 437–10 569 536, 100 baserExon 13: 10 569 683–10 569 746, 64 baserExon 14: 10 570 485–10 570 549, 65 baserExon 15: 10 577 460–10 577 520, 61 baserExon 16: 10 578 337–10 578 418, 82 baserExon 17: 10 578 517–10 578 605, 89 baserExon 18: 10 590 462–10 590 523, 62 baserExon 19: 10 592 293–10 592 373, 81 baserExon 20: 10 595 982–10 596 087, 106 baserExon 21: 10 598 015–10 598 094, 80 baserExon 22: 10 602 058–10 602 150, 93 baserExon 23: 10 603 562–10 603 632, 71 baserExon 24: 10 605 417–10 605 716, 300 baser15101520245′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 2,1 kb av genens 84,1 kb, och 1 656 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av TPTE

70Svår

Hur svår TPTE är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Stora delar av TPTE ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.

Det som tillkommer: andelen av TPTEs exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet23 %
  • Homologi100 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner4,4 %
  • GC-innehåll12 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). TPTE-genen: transmembrane phosphatase with tensin homology. Hämtad 20 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/tpte

Vancouver

Dante Labs. TPTE-genen: transmembrane phosphatase with tensin homology [Internet]. [citerad 20 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/tpte

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test