Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

TPTE

transmembrane phosphatase with tensin homology

Shrnutí

Cytogenetická poloha
21p11.2
Souřadnice
Chromozom 21: 10 521 583–10 605 716 (GRCh38)
Exony
24 exonů na 84,1 kb
Protein
551 aminokyselin
Další názvy
PTEN2, CT44, TPTE1
Transkript MANE Select
ENST00000618007.5NM_199261.4
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen TPTE. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je TPTE uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 21, se závorkou u TPTE. TPTE a 0 genů poblíž na chromozomu 21, od 10 063 650 do 11 063 649.Chromozom 2121p11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.310,2 Mb10,4 Mb10,6 Mb10,8 Mb11 MbTPTE: 10 521 583–10 605 716, řetězec dopřednémTPTESchéma TPTE: 24 exonů na dopředném řetězci chromozomu 21Exon 1: 10 521 583–10 521 694, 112 bázíExon 2: 10 524 580–10 524 688, 109 bázíExon 3: 10 527 355–10 527 412, 58 bázíExon 4: 10 538 681–10 538 734, 54 bázíExon 5: 10 541 112–10 541 165, 54 bázíExon 6: 10 542 395–10 542 448, 54 bázíExon 7: 10 543 329–10 543 382, 54 bázíExon 8: 10 552 657–10 552 716, 60 bázíExon 9: 10 559 494–10 559 544, 51 bázíExon 10: 10 561 030–10 561 191, 162 bázíExon 11: 10 567 670–10 567 789, 120 bázíExon 12: 10 569 437–10 569 536, 100 bázíExon 13: 10 569 683–10 569 746, 64 bázíExon 14: 10 570 485–10 570 549, 65 bázíExon 15: 10 577 460–10 577 520, 61 bázíExon 16: 10 578 337–10 578 418, 82 bázíExon 17: 10 578 517–10 578 605, 89 bázíExon 18: 10 590 462–10 590 523, 62 bázíExon 19: 10 592 293–10 592 373, 81 bázíExon 20: 10 595 982–10 596 087, 106 bázíExon 21: 10 598 015–10 598 094, 80 bázíExon 22: 10 602 058–10 602 150, 93 bázíExon 23: 10 603 562–10 603 632, 71 bázíExon 24: 10 605 417–10 605 716, 300 bází15101520245′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,1 kb z 84,1 kb genu; 1 656 těchto bází kódují protein.

Sekvenování TPTE

70Obtížné

Jak obtížně se TPTE sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Velká část genu TPTE leží tam, kde krátká čtení mohou změnu přehlédnout nebo ji zařadit na špatné místo.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu TPTE v každém druhu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost23 %
  • Homologie100 %
  • Sdíleno s chrY0 %
  • Pokrytí referenční sekvence0 %
  • Repetice4,4 %
  • Obsah GC12 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen TPTE: transmembrane phosphatase with tensin homology. Staženo 20. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/tpte

Vancouver

Dante Labs. Gen TPTE: transmembrane phosphatase with tensin homology [Internet]. [citováno 20. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/tpte

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test