Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

PSORS1C2

psoriasis susceptibility 1 candidate 2

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
6p21.33
Koordinaatit
Kromosomi 6: 31 137 534–31 139 066 (GRCh38)
Eksonit
2 eksonia 1,5 kb:n alueella
Proteiini
136 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
SPR1
Aiemmat symbolit
C6orf17
MANE Select -transkripti
ENST00000259845.5NM_014069.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä PSORS1C2. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

PSORS1C2-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 6, jossa hakasulke osoittaa PSORS1C2-geenin sijainnin. PSORS1C2 ja 41 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 6, välillä 30 638 300–31 638 299.Kromosomi 66p21.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2730,8 Mb31 Mb31,2 Mb31,4 Mb31,6 MbATAT1: 30 626 837–30 646 835, juoste eteenpäinATAT1C6orf136: 30 647 003–30 653 225, juoste eteenpäinDHX16: 30 652 469–30 673 059, juoste taaksepäinDHX16PPP1R18: 30 676 389–30 687 895, juoste taaksepäinNRM: 30 688 047–30 691 420, juoste taaksepäinNRMMDC1: 30 699 807–30 717 562, juoste taaksepäinMDC1TUBB: 30 717 435–30 725 538, juoste eteenpäinTUBBFLOT1: 30 727 709–30 743 075, juoste taaksepäinFLOT1IER3: 30 743 199–30 744 555, juoste taaksepäinIER3DDR1: 30 876 421–30 900 978, juoste eteenpäinDDR1GTF2H4: 30 907 517–30 914 119, juoste eteenpäinVARS2: 30 914 205–30 928 614, juoste eteenpäinVARS2SFTA2: 30 931 353–30 955 636, juoste taaksepäinSFTA2SFTA2-AS1: 30 934 523–30 938 824, juoste eteenpäinSFTA2-AS1MUCL3: 30 940 973–30 954 221, juoste eteenpäinMUCL3MUC21: 30 983 718–30 989 903, juoste eteenpäinMUC21MUC22: 31 010 474–31 036 882, juoste eteenpäinMUC22C6orf15: 31 111 223–31 112 582, juoste taaksepäinPSORS1C1: 31 114 750–31 140 092, juoste eteenpäinPSORS1C1CDSN: 31 115 087–31 120 446, juoste taaksepäinCDSNPSORS1C2: 31 137 534–31 139 066, juoste taaksepäinPSORS1C2CCHCR1: 31 142 439–31 158 238, juoste taaksepäinCCHCR1TCF19: 31 158 331–31 167 252, juoste eteenpäinPOU5F1: 31 163 193–31 180 731, juoste taaksepäinHLA-C: 31 268 746–31 272 171, juoste taaksepäinHLA-CHLA-B: 31 353 195–31 367 067, juoste taaksepäinHLA-BMICA: 31 399 784–31 415 315, juoste eteenpäinMICAMICB: 31 494 881–31 511 124, juoste eteenpäinMICBMCCD1: 31 528 962–31 530 232, juoste eteenpäinMCCD1DDX39B: 31 530 217–31 542 451, juoste taaksepäinDDX39BATP6V1G2-DDX39B: 31 530 219–31 546 608, juoste taaksepäinATP6V1G2-DDX39BATP6V1G2: 31 544 444–31 548 427, juoste taaksepäinNFKBIL1: 31 546 870–31 558 829, juoste eteenpäinLTA: 31 572 054–31 574 324, juoste eteenpäinTNF: 31 575 558–31 578 336, juoste eteenpäinTNFLTB: 31 580 525–31 582 522, juoste taaksepäinLST1: 31 581 065–31 588 911, juoste eteenpäinNCR3: 31 588 895–31 593 217, juoste taaksepäinAIF1: 31 615 214–31 617 025, juoste eteenpäinAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, juoste eteenpäin: 31 622 774–31 622 860, juoste eteenpäin: 31 623 874–31 625 499, juoste eteenpäinPSORS1C2-kaavio: 2 eksonia kromosomin 6 juosteella, taaksepäinEkson 2: 31 137 534–31 138 306, 773 emästäEkson 1: 31 138 972–31 139 066, 95 emästä215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 0,9 kb geenin 1,5 kb:stä; 411 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: PSORS1C2

5Helppo

Kuinka vaikea PSORS1C2 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin PSORS1C2 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin PSORS1C2 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot2,4 %
  • GC-pitoisuus45 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). PSORS1C2-geeni: psoriasis susceptibility 1 candidate 2. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/psors1c2

Vancouver

Dante Labs. PSORS1C2-geeni: psoriasis susceptibility 1 candidate 2 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/psors1c2

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test