Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

NKIRAS1

NFKB inhibitor interacting Ras like 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
3p24.2
Koordinaatit
Kromosomi 3: 23 889 951–23 916 990 (GRCh38)
Eksonit
5 eksonia 27 kb:n alueella
Proteiini
192 aminohappoa, 21,6 kDa
Tunnetaan myös nimellä
KBRAS1, kappaB-Ras1
MANE Select -transkripti
ENST00000425478.7NM_020345.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä NKIRAS1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

NKIRAS1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 3, jossa hakasulke osoittaa NKIRAS1-geenin sijainnin. NKIRAS1 ja 5 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 3, välillä 23 403 471–24 403 470.Kromosomi 33p24.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2923,6 Mb23,8 Mb24 Mb24,2 Mb24,4 MbUBE2E2: 23 203 015–23 592 847, juoste eteenpäinUBE2E2UBE2E1: 23 805 907–23 892 208, juoste eteenpäinUBE2E1NKIRAS1: 23 889 951–23 916 990, juoste taaksepäinNKIRAS1RPL15: 23 916 591–23 924 374, juoste eteenpäinRPL15NR1D2: 23 945 258–23 996 741, juoste eteenpäinNR1D2THRB: 24 117 153–24 495 756, juoste taaksepäinTHRBNKIRAS1-kaavio: 5 eksonia kromosomin 3 juosteella, taaksepäinEkson 5: 23 889 951–23 893 337, 3 387 emästäEkson 4: 23 900 808–23 901 049, 242 emästäEkson 3: 23 910 811–23 910 921, 111 emästäEkson 2: 23 911 329–23 911 450, 122 emästäEkson 1: 23 916 784–23 916 990, 207 emästä543215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,1 kb geenin 27 kb:stä; 579 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

NKIRAS1-geenin sekvensointi

1Helppo

Kuinka vaikea NKIRAS1-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki NKIRAS1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa NKIRAS1-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot1,5 %
  • GC-pitoisuus5,1 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). NKIRAS1-geeni: NFKB inhibitor interacting Ras like 1. Haettu 21. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nkiras1

Vancouver

Dante Labs. NKIRAS1-geeni: NFKB inhibitor interacting Ras like 1 [Internet]. [viitattu 21. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nkiras1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test