Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

UPK1B

uroplakin 1B

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
3q13.32
Koordinaadid
Kromosoom 3: 119 173 598–119 205 143 (GRCh38)
Eksonid
8 eksonit, ulatus 31,5 kb
Valk
260 aminohapet
Tuntud ka kui
TSPAN20
Varasemad tähised
UPK1
MANE Select transkript
ENST00000264234.8NM_006952.4
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni UPK1B veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas UPK1B on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 3, millel on sulg kohal, kus asub UPK1B. UPK1B ja sellele lähedal asuvad 13 geeni kromosoomil 3, vahemikus 118 689 371 kuni 119 689 370.Kromosoom 33q13.32p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29118,8 Mb119 Mb119,2 Mb119,4 Mb119,6 MbIGSF11: 118 900 557–119 146 068, pöördne ahelIGSF11TEX55: 119 146 151–119 160 042, otsene ahelTEX55: 119 147 375–119 187 807, otsene ahelUPK1B: 119 173 598–119 205 143, otsene ahelUPK1BB4GALT4: 119 208 851–119 240 952, pöördne ahelB4GALT4ARHGAP31: 119 294 031–119 420 824, otsene ahelARHGAP31TMEM39A: 119 428 949–119 468 854, pöördne ahelTMEM39APOGLUT1: 119 468 791–119 494 708, otsene ahelPOGLUT1TIMMDC1: 119 498 515–119 525 090, otsene ahelTIMMDC1CD80: 119 523 073–119 580 616, pöördne ahelCD80ADPRH: 119 579 268–119 590 165, otsene ahelADPRHPLA1A: 119 597 808–119 629 818, otsene ahelPLA1APOPDC2: 119 636 457–119 665 324, pöördne ahelPOPDC2COX17: 119 654 513–119 677 621, pöördne ahelCOX17UPK1B skeem: 8 eksonit kromosoomi 3 otsene ahelalEkson 1: 119 173 598–119 173 638, 41 alustEkson 2: 119 186 714–119 186 810, 97 alustEkson 3: 119 187 775–119 187 975, 201 alustEkson 4: 119 190 245–119 190 319, 75 alustEkson 5: 119 190 982–119 191 104, 123 alustEkson 6: 119 194 219–119 194 398, 180 alustEkson 7: 119 199 057–119 199 140, 84 alustEkson 8: 119 203 917–119 205 143, 1227 alust123456785′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2 kb kogupikkusega 31,5 kb; neist 783 alust kodeerivad valku.

UPK1B sekveneerimine

3Lihtne

Kui raske on geeni UPK1B lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni UPK1B eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni UPK1B eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus2,8%
  • Homoloogia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referentsi katvus0%
  • Kordused0%
  • GC-sisaldus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). UPK1B geen: uroplakin 1B. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/upk1b

Vancouver

Dante Labs. UPK1B geen: uroplakin 1B [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/upk1b

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test