Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

TMTC1

transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
12p11.22
Koordinaadid
Kromosoom 12: 29 500 840–29 783 942 (GRCh38)
Eksonid
18 eksonit, ulatus 283,1 kb
Valk
882 aminohapet
Tuntud ka kui
ARG99, OLF, FLJ31400, FLJ41625
MANE Select transkript
ENST00000539277.6NM_001193451.2
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni TMTC1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas TMTC1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 12, millel on sulg kohal, kus asub TMTC1. TMTC1 ja sellele lähedal asuvad 3 geeni kromosoomil 12, vahemikus 29 142 391 kuni 30 142 390.Kromosoom 1212p11.22p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3329,2 Mb29,4 Mb29,6 Mb29,8 Mb30 MbFAR2: 29 149 016–29 341 130, otsene ahelFAR2ERGIC2: 29 334 763–29 381 206, pöördne ahelERGIC2OVCH1: 29 412 474–29 497 686, pöördne ahelOVCH1TMTC1: 29 500 840–29 783 942, pöördne ahelTMTC1TMTC1 skeem: 18 eksonit kromosoomi 12 pöördne ahelalEkson 18: 29 500 840–29 506 986, 6147 alustEkson 17: 29 512 043–29 512 120, 78 alustEkson 16: 29 514 482–29 514 604, 123 alustEkson 15: 29 516 349–29 516 486, 138 alustEkson 14: 29 517 427–29 517 571, 145 alustEkson 13: 29 518 472–29 518 607, 136 alustEkson 12: 29 520 618–29 520 720, 103 alustEkson 11: 29 536 209–29 536 317, 109 alustEkson 10: 29 556 857–29 557 000, 144 alustEkson 9: 29 572 105–29 572 218, 114 alustEkson 8: 29 583 407–29 583 574, 168 alustEkson 7: 29 604 178–29 604 299, 122 alustEkson 6: 29 633 147–29 633 336, 190 alustEkson 5: 29 751 666–29 751 872, 207 alustEkson 4: 29 755 709–29 755 885, 177 alustEkson 3: 29 758 704–29 758 777, 74 alustEkson 2: 29 767 898–29 768 075, 178 alustEkson 1: 29 783 450–29 783 942, 493 alust181510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 8,8 kb kogupikkusega 283,1 kb; neist 2649 alust kodeerivad valku.

TMTC1 sekveneerimine

2Kerge

Kui raske on geeni TMTC1 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st

Peaaegu kõik geeni TMTC1 eksonid asuvad kohtades, kus lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis seda veel suurendab: geeni TMTC1 eksonite osa igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Korduvused4,2%
  • GC-sisaldus12%
  • Referentskatvus0%

Dante Labsi skoor meie enda uurimistöö põhjal, mis tugineb NISTi Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavatest piirkondadest.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). TMTC1 geen: transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tmtc1

Vancouver

Dante Labs. TMTC1 geen: transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tmtc1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test