Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

PCDH11X

protocadherin 11 X-linked

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
Xq21.31
Koordinaadid
Kromosoom X: 91 779 375–92 623 230 (GRCh38)
Eksonid
11 eksonit, ulatus 843,9 kb
Valk
1347 aminohapet
Tuntud ka kui
PCDH-X, PCDHX, PPP1R119
Varasemad tähised
PCDH11
MANE Select transkript
ENST00000682573.1NM_032968.5
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PCDH11X veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PCDH11X on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom X, millel on sulg kohal, kus asub PCDH11X. PCDH11X ja sellele lähedal asuv 1 geen kromosoomil X, vahemikus 90 935 519 kuni 93 467 086.Kromosoom XXq21.31p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2891 Mb91,5 Mb92 Mb92,5 Mb93 MbPABPC5: 91 434 595–91 441 885, otsene ahelPABPC5PCDH11X: 91 779 375–92 623 230, otsene ahelPCDH11XPCDH11X skeem: 11 eksonit kromosoomi X otsene ahelalEkson 1: 91 779 375–91 779 684, 310 alustEkson 2: 91 809 466–91 809 634, 169 alustEkson 3: 91 810 473–91 810 578, 106 alustEkson 4: 91 811 237–91 811 295, 59 alustEkson 5: 91 835 461–91 836 044, 584 alustEkson 6: 91 876 781–91 879 273, 2493 alustEkson 7: 92 201 375–92 201 455, 81 alustEkson 8: 92 263 114–92 263 143, 30 alustEkson 9: 92 387 735–92 387 933, 199 alustEkson 10: 92 468 299–92 468 322, 24 alustEkson 11: 92 618 264–92 623 230, 4967 alust1510115′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 9 kb kogupikkusega 843,9 kb; neist 4044 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: PCDH11X

99Raske

Kui raske on geeni PCDH11X lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Suur osa geenist PCDH11X asub kohtades, kus lühikesed lugemid võivad muutuse vahele jätta või valesti paigutada.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni PCDH11X eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus92%
  • Homoloogia99%
  • Ühine chrY-ga100%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused5,3%
  • GC-sisaldus11%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PCDH11X geen: protocadherin 11 X-linked. Vaadatud 20. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pcdh11x

Vancouver

Dante Labs. PCDH11X geen: protocadherin 11 X-linked [Internet]. [viidatud 20. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pcdh11x

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test