Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

PCDH11X

protocadherin 11 X-linked

Oversigt

Cytogenetisk placering
Xq21.31
Koordinater
Kromosom X: 91.779.375–92.623.230 (GRCh38)
Exoner
11 exoner fordelt over 843,9 kb
Protein
1.347 aminosyrer
Også kendt som
PCDH-X, PCDHX, PPP1R119
Tidligere symboler
PCDH11
MANE Select-transkript
ENST00000682573.1NM_032968.5
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser PCDH11X endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er PCDH11X opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom X, med en klamme ved PCDH11X. PCDH11X og 1 gen i nærheden på kromosom X, fra 90.935.519 til 93.467.086.Kromosom XXq21.31p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2891 Mb91,5 Mb92 Mb92,5 Mb93 MbPABPC5: 91.434.595–91.441.885, fremadrettet-strengPABPC5PCDH11X: 91.779.375–92.623.230, fremadrettet-strengPCDH11XDiagram af PCDH11X: 11 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom XExon 1: 91.779.375–91.779.684, 310 baserExon 2: 91.809.466–91.809.634, 169 baserExon 3: 91.810.473–91.810.578, 106 baserExon 4: 91.811.237–91.811.295, 59 baserExon 5: 91.835.461–91.836.044, 584 baserExon 6: 91.876.781–91.879.273, 2.493 baserExon 7: 92.201.375–92.201.455, 81 baserExon 8: 92.263.114–92.263.143, 30 baserExon 9: 92.387.735–92.387.933, 199 baserExon 10: 92.468.299–92.468.322, 24 baserExon 11: 92.618.264–92.623.230, 4.967 baser1510115′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 9 kb af genets 843,9 kb; 4.044 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af PCDH11X

99Svær

Hvor svær PCDH11X er at sekventere med korte reads, ud af 100

Meget af PCDH11X ligger, hvor korte reads kan overse eller fejlplacere en ændring.

Det der forstærker det: andelen af PCDH11Xs eksoner i hver type svært område

  • Mappability92 %
  • Homologi99 %
  • Delt med chrY100 %
  • Referencedækning0 %
  • Gentagelser5,3 %
  • GC-indhold11 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores det

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). PCDH11X-genet: protocadherin 11 X-linked. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/pcdh11x

Vancouver

Dante Labs. PCDH11X-genet: protocadherin 11 X-linked [Internet]. [citeret 20. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/pcdh11x

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test