Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

NOPCHAP1

NOP protein chaperone 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
12q23.3
Koordinaadid
Kromosoom 12: 104 986 316–105 017 625 (GRCh38)
Eksonid
4 eksonit, ulatus 31,3 kb
Valk
185 aminohapet
Tuntud ka kui
MGC40397, DDSR1
Varasemad tähised
C12orf45
MANE Select transkript
ENST00000552951.7NM_152318.3
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni NOPCHAP1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas NOPCHAP1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 12, millel on sulg kohal, kus asub NOPCHAP1. NOPCHAP1 ja sellele lähedal asuvad 6 geeni kromosoomil 12, vahemikus 104 501 971 kuni 105 501 970.Kromosoom 1212q23.3p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.33104,6 Mb104,8 Mb105 Mb105,2 Mb105,4 MbCHST11: 104 455 295–104 762 014, otsene ahelCHST11SLC41A2: 104 801 801–104 958 759, pöördne ahelSLC41A2NOPCHAP1: 104 986 316–105 017 625, otsene ahelNOPCHAP1ALDH1L2: 105 019 784–105 107 643, pöördne ahelALDH1L2WASHC4: 105 107 324–105 169 401, otsene ahelWASHC4APPL2: 105 172 485–105 236 228, pöördne ahelAPPL2C12orf75: 105 235 290–105 412 882, otsene ahelC12orf75NOPCHAP1 skeem: 4 eksonit kromosoomi 12 otsene ahelalEkson 1: 104 986 316–104 986 467, 152 alustEkson 2: 104 988 167–104 988 253, 87 alustEkson 3: 104 991 712–104 991 848, 137 alustEkson 4: 104 994 478–105 017 625, 23 148 alust12345′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 23,5 kb kogupikkusega 31,3 kb; neist 558 alust kodeerivad valku.

NOPCHAP1 sekveneerimine

2Kerge

Kui raske on geeni NOPCHAP1 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st

Peaaegu kõik geeni NOPCHAP1 eksonid asuvad kohtades, kus lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis seda veel suurendab: geeni NOPCHAP1 eksonite osa igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus4,7%
  • Homoloogia0%
  • Korduvused3%
  • GC-sisaldus2,9%
  • Referentskatvus0%

Dante Labsi skoor meie enda uurimistöö põhjal, mis tugineb NISTi Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavatest piirkondadest.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). NOPCHAP1 geen: NOP protein chaperone 1. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/nopchap1

Vancouver

Dante Labs. NOPCHAP1 geen: NOP protein chaperone 1 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/nopchap1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test