Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

COL16A1

collagen type XVI alpha 1 chain

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1p35.2
Koordinaadid
Kromosoom 1: 31 652 263–31 704 017 (GRCh38)
Eksonid
71 eksonit, ulatus 51,8 kb
Valk
1604 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000373672.8NM_001856.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni COL16A1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas COL16A1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub COL16A1. COL16A1 ja sellele lähedal asuvad 16 geeni kromosoomil 1, vahemikus 31 178 140 kuni 32 178 139.Kromosoom 11p35.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4431,2 Mb31,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 MbNKAIN1: 31 179 084–31 239 992, pöördne ahelNKAIN1SNRNP40: 31 259 042–31 296 823, pöördne ahelSNRNP40ZCCHC17: 31 296 942–31 371 032, otsene ahelZCCHC17FABP3: 31 359 583–31 376 850, pöördne ahelFABP3SERINC2: 31 409 565–31 434 680, otsene ahelSERINC2TINAGL1: 31 576 357–31 587 691, otsene ahelTINAGL1HCRTR1: 31 617 660–31 632 518, otsene ahelHCRTR1PEF1: 31 629 862–31 644 910, pöördne ahelPEF1COL16A1: 31 652 263–31 704 017, pöördne ahelCOL16A1ADGRB2: 31 727 117–31 764 893, pöördne ahelADGRB2SPOCD1: 31 790 421–31 816 022, pöördne ahelSPOCD1PTP4A2: 31 906 421–31 944 856, pöördne ahelPTP4A2: 31 919 563–31 938 010, pöördne ahelKHDRBS1: 32 013 687–32 060 850, otsene ahelKHDRBS1TMEM39B: 32 072 031–32 102 866, otsene ahelTMEM39BKPNA6: 32 108 028–32 176 563, otsene ahelKPNA6TXLNA: 32 178 097–32 198 299, otsene ahelTXLNACOL16A1 skeem: 71 eksonit kromosoomi 1 pöördne ahelalEkson 71: 31 652 263–31 652 853, 591 alustEkson 70: 31 653 599–31 653 676, 78 alustEkson 69: 31 653 867–31 654 043, 177 alustEkson 68: 31 654 792–31 654 858, 67 alustEkson 67: 31 655 314–31 655 502, 189 alustEkson 66: 31 656 400–31 656 444, 45 alustEkson 65: 31 657 033–31 657 068, 36 alustEkson 64: 31 658 488–31 658 577, 90 alustEkson 63: 31 658 914–31 658 964, 51 alustEkson 62: 31 660 585–31 660 638, 54 alustEkson 61: 31 661 066–31 661 119, 54 alustEkson 60: 31 661 414–31 661 458, 45 alustEkson 59: 31 661 660–31 661 704, 45 alustEkson 58: 31 662 334–31 662 387, 54 alustEkson 57: 31 662 587–31 662 658, 72 alustEkson 56: 31 665 172–31 665 234, 63 alustEkson 55: 31 665 583–31 665 618, 36 alustEkson 54: 31 665 882–31 665 935, 54 alustEkson 53: 31 666 037–31 666 081, 45 alustEkson 52: 31 667 575–31 667 628, 54 alustEkson 51: 31 668 165–31 668 218, 54 alustEkson 50: 31 668 802–31 668 855, 54 alustEkson 49: 31 670 602–31 670 646, 45 alustEkson 48: 31 671 615–31 671 659, 45 alustEkson 47: 31 672 416–31 672 502, 87 alustEkson 46: 31 672 596–31 672 637, 42 alustEkson 45: 31 672 724–31 672 840, 117 alustEkson 44: 31 675 007–31 675 039, 33 alustEkson 43: 31 675 258–31 675 311, 54 alustEkson 42: 31 679 632–31 679 685, 54 alustEkson 41: 31 679 804–31 679 851, 48 alustEkson 40: 31 680 042–31 680 101, 60 alustEkson 39: 31 680 905–31 680 931, 27 alustEkson 38: 31 681 023–31 681 067, 45 alustEkson 37: 31 682 934–31 683 002, 69 alustEkson 36: 31 683 194–31 683 247, 54 alustEkson 35: 31 683 334–31 683 369, 36 alustEkson 34: 31 683 707–31 683 748, 42 alustEkson 33: 31 683 950–31 684 003, 54 alustEkson 32: 31 684 109–31 684 231, 123 alustEkson 31: 31 684 523–31 684 630, 108 alustEkson 30: 31 684 821–31 684 856, 36 alustEkson 29: 31 685 639–31 685 770, 132 alustEkson 28: 31 686 091–31 686 135, 45 alustEkson 27: 31 686 244–31 686 279, 36 alustEkson 26: 31 688 467–31 688 502, 36 alustEkson 25: 31 688 861–31 688 971, 111 alustEkson 24: 31 689 050–31 689 085, 36 alustEkson 23: 31 689 741–31 689 851, 111 alustEkson 22: 31 690 367–31 690 393, 27 alustEkson 21: 31 690 529–31 690 573, 45 alustEkson 20: 31 691 188–31 691 226, 39 alustEkson 19: 31 691 417–31 691 512, 96 alustEkson 18: 31 691 598–31 691 642, 45 alustEkson 17: 31 692 005–31 692 067, 63 alustEkson 16: 31 692 474–31 692 509, 36 alustEkson 15: 31 692 598–31 692 642, 45 alustEkson 14: 31 692 767–31 692 808, 42 alustEkson 13: 31 693 092–31 693 154, 63 alustEkson 12: 31 694 144–31 694 170, 27 alustEkson 11: 31 695 186–31 695 221, 36 alustEkson 10: 31 695 761–31 695 787, 27 alustEkson 9: 31 696 088–31 696 141, 54 alustEkson 8: 31 696 963–31 697 088, 126 alustEkson 7: 31 697 220–31 697 300, 81 alustEkson 6: 31 697 906–31 698 172, 267 alustEkson 5: 31 698 483–31 698 606, 124 alustEkson 4: 31 699 813–31 699 930, 118 alustEkson 3: 31 700 041–31 700 115, 75 alustEkson 2: 31 702 121–31 702 227, 107 alustEkson 1: 31 703 837–31 704 017, 181 alust7160402015′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 5,4 kb kogupikkusega 51,8 kb; neist 4815 alust kodeerivad valku.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). COL16A1 geen: collagen type XVI alpha 1 chain. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/col16a1

Vancouver

Dante Labs. COL16A1 geen: collagen type XVI alpha 1 chain [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/col16a1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test