Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

COL16A1

collagen type XVI alpha 1 chain

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
1p35.2
Koordinaatit
Kromosomi 1: 31 652 263–31 704 017 (GRCh38)
Eksonit
71 eksonia 51,8 kb:n alueella
Proteiini
1 604 aminohappoa
MANE Select -transkripti
ENST00000373672.8NM_001856.4
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä COL16A1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

COL16A1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 1, jossa hakasulke osoittaa COL16A1-geenin sijainnin. COL16A1 ja 16 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 1, välillä 31 178 140–32 178 139.Kromosomi 11p35.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4431,2 Mb31,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 MbNKAIN1: 31 179 084–31 239 992, juoste taaksepäinNKAIN1SNRNP40: 31 259 042–31 296 823, juoste taaksepäinSNRNP40ZCCHC17: 31 296 942–31 371 032, juoste eteenpäinZCCHC17FABP3: 31 359 583–31 376 850, juoste taaksepäinFABP3SERINC2: 31 409 565–31 434 680, juoste eteenpäinSERINC2TINAGL1: 31 576 357–31 587 691, juoste eteenpäinTINAGL1HCRTR1: 31 617 660–31 632 518, juoste eteenpäinHCRTR1PEF1: 31 629 862–31 644 910, juoste taaksepäinPEF1COL16A1: 31 652 263–31 704 017, juoste taaksepäinCOL16A1ADGRB2: 31 727 117–31 764 893, juoste taaksepäinADGRB2SPOCD1: 31 790 421–31 816 022, juoste taaksepäinSPOCD1PTP4A2: 31 906 421–31 944 856, juoste taaksepäinPTP4A2: 31 919 563–31 938 010, juoste taaksepäinKHDRBS1: 32 013 687–32 060 850, juoste eteenpäinKHDRBS1TMEM39B: 32 072 031–32 102 866, juoste eteenpäinTMEM39BKPNA6: 32 108 028–32 176 563, juoste eteenpäinKPNA6TXLNA: 32 178 097–32 198 299, juoste eteenpäinTXLNACOL16A1-kaavio: 71 eksonia kromosomin 1 juosteella, taaksepäinEkson 71: 31 652 263–31 652 853, 591 emästäEkson 70: 31 653 599–31 653 676, 78 emästäEkson 69: 31 653 867–31 654 043, 177 emästäEkson 68: 31 654 792–31 654 858, 67 emästäEkson 67: 31 655 314–31 655 502, 189 emästäEkson 66: 31 656 400–31 656 444, 45 emästäEkson 65: 31 657 033–31 657 068, 36 emästäEkson 64: 31 658 488–31 658 577, 90 emästäEkson 63: 31 658 914–31 658 964, 51 emästäEkson 62: 31 660 585–31 660 638, 54 emästäEkson 61: 31 661 066–31 661 119, 54 emästäEkson 60: 31 661 414–31 661 458, 45 emästäEkson 59: 31 661 660–31 661 704, 45 emästäEkson 58: 31 662 334–31 662 387, 54 emästäEkson 57: 31 662 587–31 662 658, 72 emästäEkson 56: 31 665 172–31 665 234, 63 emästäEkson 55: 31 665 583–31 665 618, 36 emästäEkson 54: 31 665 882–31 665 935, 54 emästäEkson 53: 31 666 037–31 666 081, 45 emästäEkson 52: 31 667 575–31 667 628, 54 emästäEkson 51: 31 668 165–31 668 218, 54 emästäEkson 50: 31 668 802–31 668 855, 54 emästäEkson 49: 31 670 602–31 670 646, 45 emästäEkson 48: 31 671 615–31 671 659, 45 emästäEkson 47: 31 672 416–31 672 502, 87 emästäEkson 46: 31 672 596–31 672 637, 42 emästäEkson 45: 31 672 724–31 672 840, 117 emästäEkson 44: 31 675 007–31 675 039, 33 emästäEkson 43: 31 675 258–31 675 311, 54 emästäEkson 42: 31 679 632–31 679 685, 54 emästäEkson 41: 31 679 804–31 679 851, 48 emästäEkson 40: 31 680 042–31 680 101, 60 emästäEkson 39: 31 680 905–31 680 931, 27 emästäEkson 38: 31 681 023–31 681 067, 45 emästäEkson 37: 31 682 934–31 683 002, 69 emästäEkson 36: 31 683 194–31 683 247, 54 emästäEkson 35: 31 683 334–31 683 369, 36 emästäEkson 34: 31 683 707–31 683 748, 42 emästäEkson 33: 31 683 950–31 684 003, 54 emästäEkson 32: 31 684 109–31 684 231, 123 emästäEkson 31: 31 684 523–31 684 630, 108 emästäEkson 30: 31 684 821–31 684 856, 36 emästäEkson 29: 31 685 639–31 685 770, 132 emästäEkson 28: 31 686 091–31 686 135, 45 emästäEkson 27: 31 686 244–31 686 279, 36 emästäEkson 26: 31 688 467–31 688 502, 36 emästäEkson 25: 31 688 861–31 688 971, 111 emästäEkson 24: 31 689 050–31 689 085, 36 emästäEkson 23: 31 689 741–31 689 851, 111 emästäEkson 22: 31 690 367–31 690 393, 27 emästäEkson 21: 31 690 529–31 690 573, 45 emästäEkson 20: 31 691 188–31 691 226, 39 emästäEkson 19: 31 691 417–31 691 512, 96 emästäEkson 18: 31 691 598–31 691 642, 45 emästäEkson 17: 31 692 005–31 692 067, 63 emästäEkson 16: 31 692 474–31 692 509, 36 emästäEkson 15: 31 692 598–31 692 642, 45 emästäEkson 14: 31 692 767–31 692 808, 42 emästäEkson 13: 31 693 092–31 693 154, 63 emästäEkson 12: 31 694 144–31 694 170, 27 emästäEkson 11: 31 695 186–31 695 221, 36 emästäEkson 10: 31 695 761–31 695 787, 27 emästäEkson 9: 31 696 088–31 696 141, 54 emästäEkson 8: 31 696 963–31 697 088, 126 emästäEkson 7: 31 697 220–31 697 300, 81 emästäEkson 6: 31 697 906–31 698 172, 267 emästäEkson 5: 31 698 483–31 698 606, 124 emästäEkson 4: 31 699 813–31 699 930, 118 emästäEkson 3: 31 700 041–31 700 115, 75 emästäEkson 2: 31 702 121–31 702 227, 107 emästäEkson 1: 31 703 837–31 704 017, 181 emästä7160402015′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 5,4 kb geenin 51,8 kb:stä; 4 815 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). COL16A1-geeni: collagen type XVI alpha 1 chain. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/col16a1

Vancouver

Dante Labs. COL16A1-geeni: collagen type XVI alpha 1 chain [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/col16a1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test