Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

CDH18

cadherin 18

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
5p14.3
Koordinaadid
Kromosoom 5: 19 471 296–19 988 200 (GRCh38)
Eksonid
13 eksonit, ulatus 516,9 kb
Valk
790 aminohapet
Tuntud ka kui
CDH14, EY-CADHERIN
MANE Select transkript
ENST00000382275.6NM_004934.5
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni CDH18 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas CDH18 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 5, millel on sulg kohal, kus asub CDH18. CDH18 ja sellele lähedal asuvad 0 geeni kromosoomil 5, vahemikus 18 954 391 kuni 20 505 105.Kromosoom 55p14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.319 Mb19,2 Mb19,4 Mb19,6 Mb19,8 Mb20 Mb20,2 Mb20,4 MbCDH18: 19 471 296–19 988 200, pöördne ahelCDH18CDH18 skeem: 13 eksonit kromosoomi 5 pöördne ahelalEkson 13: 19 471 296–19 473 716, 2421 alustEkson 12: 19 483 301–19 483 552, 252 alustEkson 11: 19 502 992–19 503 109, 118 alustEkson 10: 19 520 657–19 520 778, 122 alustEkson 9: 19 543 869–19 544 005, 137 alustEkson 8: 19 571 579–19 571 832, 254 alustEkson 7: 19 591 057–19 591 244, 188 alustEkson 6: 19 612 434–19 612 601, 168 alustEkson 5: 19 721 347–19 721 466, 120 alustEkson 4: 19 746 942–19 747 236, 295 alustEkson 3: 19 838 759–19 839 242, 484 alustEkson 2: 19 981 060–19 981 178, 119 alustEkson 1: 19 988 086–19 988 200, 115 alust1310515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,8 kb kogupikkusega 516,9 kb; neist 2373 alust kodeerivad valku.

CDH18 sekveneerimine

1Kerge

Kui raske on geeni CDH18 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st

Peaaegu kõik geeni CDH18 eksonid asuvad kohtades, kus lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis seda veel suurendab: geeni CDH18 eksonite osa igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Korduvused2,8%
  • GC-sisaldus4,7%
  • Referentskatvus0%

Dante Labsi skoor meie enda uurimistöö põhjal, mis tugineb NISTi Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavatest piirkondadest.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). CDH18 geen: cadherin 18. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cdh18

Vancouver

Dante Labs. CDH18 geen: cadherin 18 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cdh18

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test