Geen
CBY2
chibby family member 2
- HGNC 30720↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000174015↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 220082↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 13q14.13
- Koordinaadid
- Kromosoom 13: 45 702 320–45 714 559 (GRCh38)
- Eksonid
- 3 eksonit, ulatus 12,2 kb
- Valk
- 448 aminohapet
- Tuntud ka kui
- NURIT
- Varasemad tähised
- SPERT
- MANE Select transkript
- ENST00000310521.6NM_152719.3
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cby2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe CBY2 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni CBY2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas CBY2 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,6 kb kogupikkusega 12,2 kb; neist 1347 alust kodeerivad valku.
CBY2 sekveneerimine
5Lihtne
Kui raske on CBY2 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st
0 · Easy100 · Hard
Almost all of CBY2's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of CBY2's exons in each kind of hard region
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tuvastus puududa või olla vale. Kaal 35%.0%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: genoomi teised koopiad, nagu paraloogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- Korduvad järjestusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi täielikult katta. Kaal 15%.7,4%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-aluseid on alla 25% või üle 65%, mida raamatukogu ettevalmistus katab hõredalt. Kaal 10%.37%
- Referentsi katvusLähedal asuvad lüngad referentskoostises, kus lugemitel pole joondamiseks järjestust. Kaal 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredIga riba näitab, kui suur osa geeni CBY2 eksonite aluspaaridest asub sellist tüüpi raskes piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga tüüp lühikeste lugemite tuvastust takistab: 0, kui ükski alus ei asu üheski, ja 100, kui iga alus asub kõigis neist.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CBY2 geen: chibby family member 2. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cby2
Dante Labs. CBY2 geen: chibby family member 2 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cby2
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast