Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

ATP5F1C

ATP synthase F1 subunit gamma

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
10p14
Koordinaadid
Kromosoom 10: 7 788 177–7 807 801 (GRCh38)
Eksonid
10 eksonit, ulatus 19,6 kb
Valk
298 aminohapet
Varasemad tähised
ATP5CL1, ATP5C, ATP5C1
MANE Select transkript
ENST00000356708.12NM_001001973.3
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni ATP5F1C veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas ATP5F1C on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 10, millel on sulg kohal, kus asub ATP5F1C. ATP5F1C ja sellele lähedal asuvad 6 geeni kromosoomil 10, vahemikus 7 297 989 kuni 8 297 988.Kromosoom 1010p14p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.37,4 Mb7,6 Mb7,8 Mb8 Mb8,2 MbSFMBT2: 7 158 624–7 411 497, pöördne ahelSFMBT2ITIH5: 7 559 270–7 667 021, pöördne ahelITIH5ITIH2: 7 699 386–7 758 675, otsene ahelITIH2KIN: 7 750 962–7 788 001, pöördne ahelKINATP5F1C: 7 788 177–7 807 801, otsene ahelATP5F1CTAF3: 7 818 497–8 016 631, otsene ahelTAF3GATA3: 8 045 212–8 075 825, otsene ahelGATA3ATP5F1C skeem: 10 eksonit kromosoomi 10 otsene ahelalEkson 1: 7 788 177–7 788 263, 87 alustEkson 2: 7 796 121–7 796 155, 35 alustEkson 3: 7 797 047–7 797 178, 132 alustEkson 4: 7 798 990–7 799 194, 205 alustEkson 5: 7 799 772–7 799 915, 144 alustEkson 6: 7 800 027–7 800 091, 65 alustEkson 7: 7 802 270–7 802 425, 156 alustEkson 8: 7 802 758–7 802 854, 97 alustEkson 9: 7 806 974–7 807 010, 37 alustEkson 10: 7 807 659–7 807 801, 143 alust12468105′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,1 kb kogupikkusega 19,6 kb; neist 897 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: ATP5F1C

9Lihtne

Kui raske on geeni ATP5F1C lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni ATP5F1C eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni ATP5F1C eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus4,9%
  • Homoloogia0%
  • Ühine chrY-ga0%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused2,7%
  • GC-sisaldus16%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). ATP5F1C geen: ATP synthase F1 subunit gamma. Vaadatud 20. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/atp5f1c

Vancouver

Dante Labs. ATP5F1C geen: ATP synthase F1 subunit gamma [Internet]. [viidatud 20. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/atp5f1c

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test