Gen
SPRYD7
SPRY domain containing 7
- HGNC 14297↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000123178↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 57213↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 13q14.2
- Coordenadas
- Cromosoma 13: 49.912.702–49.936.340 (GRCh38)
- Exones
- 5 exones en 23,6 kb
- Proteína
- 196 aminoácidos
- También conocido como
- CLLD6
- Símbolos anteriores
- C13orf1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000361840.8NM_020456.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Obtener mi Genome TestInformes revisados relevantes para este gen
Ningún informe de Genome Test lee aún SPRYD7. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.
Estructura de SPRYD7
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 3,1 kb de los 23,6 kb del gen; 591 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de SPRYD7
4Fácil
Lo difícil que es secuenciar SPRYD7 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of SPRYD7's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of SPRYD7's exons in each kind of hard region
- MapeabilidadTramos donde las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada en ellos puede faltar o ser errónea. Peso 35 %.0,1 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o superior. Peso 30 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas resbalan y pueden no abarcarlas. Peso 15 %.5,1 %
- Contenido de GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma deficiente. Peso 10 %.29 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia a la que las lecturas puedan alinearse. Peso 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredCada barra es la proporción de las bases de exones de SPRYD7 en ese tipo de región difícil. La puntuación las pondera según cuánto encarece cada una una llamada con lecturas cortas: 0 cuando ninguna base está en ninguna, 100 cuando cada base está en todas.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen SPRYD7: SPRY domain containing 7. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/spryd7
Dante Labs. Gen SPRYD7: SPRY domain containing 7 [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/spryd7
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